RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.31■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.3■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.29■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
HOXC11-201ENST00000243082 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 SYNMO15061 1565 aa25.26■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 PIK3C2BO00750 1634 aa25.25■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 RALBP1Q15311 655 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 PPLO60437 1756 aa25.24■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.23■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.21■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 REREQ9P2R6 1566 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 PANK3Q9H999 370 aa25.2■■□□□ 1.63
HOXC11-201ENST00000243082 PIK3C2GO75747 1445 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 AGLP35573 1532 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 IDI1Q13907 227 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 CDCA8Q53HL2 280 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 TMC1Q8TDI8 760 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXC11-201ENST00000243082 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.13■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.12■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 ADGRB1O14514 1584 aa25.11■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 SLC24A1O60721 1099 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.1■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 ERVK-7P63135 1459 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 NLRP13Q86W25 1043 aa25.08■■□□□ 1.61
HOXC11-201ENST00000243082 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.07■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 MYOM1P52179 1685 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 FKBP8Q14318 412 aa25.06■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 ZFYVE9O95405 1425 aa25.05■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXC11-201ENST00000243082 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXC11-201ENST00000243082 NEFLP07196 543 aa25■■□□□ 1.59
HOXC11-201ENST00000243082 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXC11-201ENST00000243082 MLECQ14165 292 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXC11-201ENST00000243082 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 QRICH2Q9H0J4 1663 aa24.95■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa24.94■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 BCANQ96GW7 911 aa24.9■■□□□ 1.58
HOXC11-201ENST00000243082 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.89■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 PPP2R1AP30153 589 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.88■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.87■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 ZMYM3Q14202 1370 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa24.86■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 INSRP06213 1382 aa24.85■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
HOXC11-201ENST00000243082 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 NUDCQ9Y266 331 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 TULP4Q9NRJ4 1543 aa24.82■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 ALKQ9UM73 1620 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 STK26Q9P289 416 aa24.81■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 EVC2Q86UK5 1308 aa24.8■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP24.79■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 PTPRMP28827 1452 aa24.79■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
HOXC11-201ENST00000243082 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP24.76■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.75■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.74■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 PRAM1Q96QH2 718 aa24.73■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 CABP2Q9NPB3 220 aa24.72■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 TNRQ92752 1358 aa24.71■■□□□ 1.55
HOXC11-201ENST00000243082 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
HOXC11-201ENST00000243082 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
HOXC11-201ENST00000243082 POGKQ9P215 609 aa24.69■■□□□ 1.54
HOXC11-201ENST00000243082 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa24.68■■□□□ 1.54
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