RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237696.9

RARRES1-201, Transcript of retinoic acid receptor responder 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RARRES1, Length 1,952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES1-201ENST00000237696 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.82■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 PIK3C2BO00750 1634 aa25.81■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 CFAP70Q5T0N1 1121 aa25.79■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 ERVK-7P63135 1459 aa25.78■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 STAC3Q96MF2 364 aa25.78■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 IFT172Q9UG01 1749 aa25.77■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.76■■□□□ 1.72
RARRES1-201ENST00000237696 MYOM2P54296 1465 aa25.76■■□□□ 1.71
RARRES1-201ENST00000237696 ZMYM3Q14202 1370 aa25.73■■□□□ 1.71
RARRES1-201ENST00000237696 LAMC1P11047 1609 aa25.72■■□□□ 1.71
RARRES1-201ENST00000237696 PPLO60437 1756 aa25.71■■□□□ 1.71
RARRES1-201ENST00000237696 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.7■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 ANP32CO43423 234 aa25.69■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 NRXN1Q9ULB1 1477 aa25.69■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.69■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 TESK2Q96S53 571 aa25.67■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.67■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.67■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.67■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.66■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.65■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 PIK3C2GO75747 1445 aa25.64■■□□□ 1.7
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM132EQ6IEE7 984 aa25.64■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 IQGAP1P46940 1657 aa25.63■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.63■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.63■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RARRES1-201ENST00000237696 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.56■■□□□ 1.68
RARRES1-201ENST00000237696 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.56■■□□□ 1.68
RARRES1-201ENST00000237696 TNRQ92752 1358 aa25.56■■□□□ 1.68
RARRES1-201ENST00000237696 TMF1P82094 1093 aa25.55■■□□□ 1.68
RARRES1-201ENST00000237696 ADGRB1O14514 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
RARRES1-201ENST00000237696 ZFYVE9O95405 1425 aa25.5■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 CCER2I3L3R5 266 aa25.5■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa25.49■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.49■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 RIMS2Q9UQ26 1411 aa25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa25.47■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 STK26Q9P289 416 aa25.47■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 C3P01024 1663 aa25.46■■□□□ 1.67
RARRES1-201ENST00000237696 CCDC184Q52MB2 194 aa25.43■■□□□ 1.66
RARRES1-201ENST00000237696 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa25.43■■□□□ 1.66
RARRES1-201ENST00000237696 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
RARRES1-201ENST00000237696 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-201ENST00000237696 PANK3Q9H999 370 aa25.4■■□□□ 1.66
RARRES1-201ENST00000237696 ALKQ9UM73 1620 aa25.39■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.37■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.36■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.35■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 PTPRMP28827 1452 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 CDCA8Q53HL2 280 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 QRICH2Q9H0J4 1663 aa25.34■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 BCANQ96GW7 911 aa25.33■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 NLRP1Q9C000 1473 aa25.33■■□□□ 1.65
RARRES1-201ENST00000237696 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 LTKP29376 864 aa25.32■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 FKBP8Q14318 412 aa25.31■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 NEFLP07196 543 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 PRAM1Q96QH2 718 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa25.29■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 HDGFP51858 240 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 MRS2Q9HD23 443 aa25.28■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 METP08581 1390 aa25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.27■■□□□ 1.64
RARRES1-201ENST00000237696 MYOM1P52179 1685 aa25.26■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 POGKQ9P215 609 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 SLC24A1O60721 1099 aa25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 WAPLQ7Z5K2 1190 aa25.24■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 CABP2Q9NPB3 220 aa25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 TMC1Q8TDI8 760 aa25.22■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.21■■□□□ 1.63
RARRES1-201ENST00000237696 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 EID1Q9Y6B2 187 aa25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 EVC2Q86UK5 1308 aa25.2■■□□□ 1.62
RARRES1-201ENST00000237696 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms