RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227756.4

GALNT18-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT18, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18-201ENST00000227756 ABCA6Q8N139 1617 aa22.77■■□□□ 1.24
GALNT18-201ENST00000227756 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
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GALNT18-201ENST00000227756 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.75■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 MYOM2P54296 1465 aa22.75■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 NPATQ14207 1427 aa22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 CDCA8Q53HL2 280 aa22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 MROH2AA6NES4 1674 aa22.74■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.73■■□□□ 1.23
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GALNT18-201ENST00000227756 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.71■■□□□ 1.23
GALNT18-201ENST00000227756 IFT172Q9UG01 1749 aa22.7■■□□□ 1.22
GALNT18-201ENST00000227756 ABCC3O15438 1527 aa22.69■■□□□ 1.22
GALNT18-201ENST00000227756 KNSTRNQ9Y448 316 aa22.69■■□□□ 1.22
GALNT18-201ENST00000227756 NOS1P29475 1434 aa22.68■■□□□ 1.22
GALNT18-201ENST00000227756 ADGRB3O60242 1522 aa22.68■■□□□ 1.22
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GALNT18-201ENST00000227756 RICTORQ6R327 1708 aa22.64■■□□□ 1.22
GALNT18-201ENST00000227756 SYNMO15061 1565 aa22.64■■□□□ 1.21
GALNT18-201ENST00000227756 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
GALNT18-201ENST00000227756 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.62■■□□□ 1.21
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GALNT18-201ENST00000227756 SLC24A1O60721 1099 aa22.61■■□□□ 1.21
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GALNT18-201ENST00000227756 GLI2P10070 1586 aa22.58■■□□□ 1.21
GALNT18-201ENST00000227756 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.58■■□□□ 1.21
GALNT18-201ENST00000227756 ERVK-7P63135 1459 aa22.58■■□□□ 1.21
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GALNT18-201ENST00000227756 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.58■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.57■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 PIK3C2GO75747 1445 aa22.57■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 PPP2R1AP30153 589 aa22.57■■□□□ 1.2
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GALNT18-201ENST00000227756 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa22.56■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.55■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
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GALNT18-201ENST00000227756 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 TMEM132EQ6IEE7 984 aa22.55■■□□□ 1.2
GALNT18-201ENST00000227756 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa22.55■■□□□ 1.2
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GALNT18-201ENST00000227756 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.52■■□□□ 1.19
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GALNT18-201ENST00000227756 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa22.49■■□□□ 1.19
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GALNT18-201ENST00000227756 ADGRB1O14514 1584 aa22.49■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.48■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 DIP2BQ9P265 1576 aa22.48■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 TSPOAP1O95153 1857 aa22.48■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
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GALNT18-201ENST00000227756 BCL11AQ9H165 835 aa22.47■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.47■■□□□ 1.19
GALNT18-201ENST00000227756 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.47■■□□□ 1.19
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GALNT18-201ENST00000227756 QRICH2Q9H0J4 1663 aa22.44■■□□□ 1.18
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GALNT18-201ENST00000227756 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
GALNT18-201ENST00000227756 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
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GALNT18-201ENST00000227756 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
GALNT18-201ENST00000227756 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa22.4■■□□□ 1.18
GALNT18-201ENST00000227756 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.38■■□□□ 1.17
GALNT18-201ENST00000227756 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.37■■□□□ 1.17
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GALNT18-201ENST00000227756 ZFYVE9O95405 1425 aa22.35■■□□□ 1.17
GALNT18-201ENST00000227756 STK26Q9P289 416 aa22.34■■□□□ 1.17
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GALNT18-201ENST00000227756 EVC2Q86UK5 1308 aa22.34■■□□□ 1.17
GALNT18-201ENST00000227756 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
GALNT18-201ENST00000227756 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa22.33■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.32■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.31■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 MLECQ14165 292 aa22.3■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 MORC1Q86VD1 984 aa22.3■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.29■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 CABP2Q9NPB3 220 aa22.29■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 TULP4Q9NRJ4 1543 aa22.29■■□□□ 1.16
GALNT18-201ENST00000227756 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
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