RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 TRPM2O94759 1503 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCC1P33527 1531 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP27Q5VZP5 1158 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 USP35Q9P2H5 1018 aa29.1■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CDCA8Q53HL2 280 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.09■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 C20orf194Q5TEA3 1177 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 PIK3C2GO75747 1445 aa29.08■■■□□ 2.25
HTATSF1-201ENST00000218364 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa29.07■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 PTPRTO14522 1441 aa29.06■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP152O94986 1710 aa29.05■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 DDRGK1Q96HY6 314 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.04■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA2Q08379 1002 aa29.03■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
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HTATSF1-201ENST00000218364 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.02■■■□□ 2.24
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOM1P52179 1685 aa29■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 SKAP1Q86WV1 359 aa29■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 CLTCL1P53675 1640 aa28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
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HTATSF1-201ENST00000218364 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 DEPDC5O75140 1603 aa28.97■■■□□ 2.23
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HTATSF1-201ENST00000218364 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa28.96■■■□□ 2.23
HTATSF1-201ENST00000218364 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.95■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.94■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 ARAP3Q8WWN8 1544 aa28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 TET3O43151 1660 aa28.93■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.89■■■□□ 2.22
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM161AQ3B820 660 aa28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC24A1O60721 1099 aa28.88■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 C8orf34Q49A92 452 aa28.85■■■□□ 2.21
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HTATSF1-201ENST00000218364 ASXL2Q76L83 1435 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 AFAP1Q8N556 730 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 MYOM2P54296 1465 aa28.83■■■□□ 2.21
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-7P63135 1459 aa28.82■■■□□ 2.2
HTATSF1-201ENST00000218364 KANK1Q14678 1352 aa28.81■■■□□ 2.2
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC146Q8IYE0 955 aa28.81■■■□□ 2.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa28.8■■■□□ 2.2
HTATSF1-201ENST00000218364 E9PSI1 815 aa28.8■■■□□ 2.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 ABCA6Q8N139 1617 aa28.77■■■□□ 2.2
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HTATSF1-201ENST00000218364 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.73■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 BCAR3O75815 825 aa28.72■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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HTATSF1-201ENST00000218364 NINLQ9Y2I6 1382 aa28.71■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCA9Q8IUA7 1624 aa28.7■■■□□ 2.19
HTATSF1-201ENST00000218364 IFT172Q9UG01 1749 aa28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 NRXN1Q9ULB1 1477 aa28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 PDE3AQ14432 1141 aa28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.69■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC4A3P48751 1232 aa28.68■■■□□ 2.18
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HTATSF1-201ENST00000218364 RGS3P49796 1198 aa28.67■■■□□ 2.18
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HTATSF1-201ENST00000218364 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.67■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF1BO60333 1816 aa28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 FANCAO15360 1455 aa28.65■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 GSE1Q14687 1217 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.64■■■□□ 2.18
HTATSF1-201ENST00000218364 IGHDP01880 384 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 WWC1Q8IX03 1113 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 IL27Q8NEV9 243 aa28.62■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa28.61■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 MROH2AA6NES4 1674 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 SHPRHQ149N8 1683 aa28.59■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.58■■■□□ 2.17
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRL1O94910 1474 aa28.57■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa28.56■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
HTATSF1-201ENST00000218364 ADGRB3O60242 1522 aa28.55■■■□□ 2.16
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