RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000188417.1

Gm28718-201, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gm28718, Length 2,168 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28718-201ENSMUST00000188417 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cux1P53564 1515 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm6268A2A3U9 297 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 PtprkP35822 1457 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Trim30dE9PWL0 497 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zscan21Q07231 555 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zbtb7bQ64321 544 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Q8BT18 775 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ubl4bQ9CQ84 188 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ush1cQ9ES64 910 aa9.94□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mknk2Q8CDB0 459 aa9.93□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Samd1D3YXK1 519 aa9.92□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ssh1Q76I79 1042 aa9.92□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 PygbQ8CI94 843 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Stac3Q8BZ71 360 aa9.91□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ccdc94Q9D6J3 314 aa9.91□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Shroom4Q1W617 1475 aa9.91□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lamc1P02468 1607 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rabep1O35551 862 aa9.91□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 ScaperF8VQ70 1398 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm1043A0A140LJC2 1431 aa9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm7298A0A0N4SVU1 1476 aa9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 A2mQ6GQT1 1474 aa9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 FanciQ8K368 1330 aa9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Usp47Q8BY87 1376 aa9.9□□□□□ -0.82
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Naip6Q9JIB6 1403 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mphosph9A6H5Y1 991 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fez1Q8K0X8 392 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rwdd1Q9CQK7 243 aa9.9□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Chmp4bQ9D8B3 224 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Kif15Q6P9L6 1387 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Clasp1Q80TV8 1535 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Becn1O88597 448 aa9.89□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mbd5B1AYB6 1498 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tnpo1Q8BFY9 898 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fam135aQ6NS59 1506 aa9.88□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 SlkO54988 1233 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ccnb3Q810T2 1396 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Pik3c2gO70167 1506 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rps6ka5Q8C050 863 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa9.87□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Plekhh1Q80TI1 1356 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ferd3lQ923Z4 168 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mroh2bQ7M6Y6 1581 aa9.86□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tbc1d32Q3URV1 1296 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Atad2Q8CDM1 1040 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rfx7F8VPJ6 1459 aa9.85□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Dcaf11Q91VU6 549 aa9.84□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lamc3Q9R0B6 1581 aa9.84□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mug1P28665 1476 aa9.84□□□□□ -0.83
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Dapk1Q80YE7 1442 aa9.83□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gm45140A0A0N4SUM8 220 aa9.83□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 NcapgE9PWG6 1004 aa9.83□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Catsper2A2ARP9 588 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Wdr78E9PYY5 807 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Terf2O35144 541 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ddit3P35639 168 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Igf1rQ60751 1373 aa9.82□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Plcb2A3KGF7 1181 aa9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Esx1O88933 382 aa9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Pdap1Q3UHX2 181 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Kif16bB1AVY7 1312 aa9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gtpbp4Q99ME9 634 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa9.81□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ppp2r3aB2RXC8 1150 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Pkd2O35245 966 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lmod2Q3UHZ5 550 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gzf1Q4VBD9 706 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rad21Q61550 635 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Q7TT23 1179 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Pnma3Q8JZW8 466 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fam114a1Q9D281 569 aa9.8□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa9.79□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cux2P70298 1426 aa9.79□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Kif3aP28741 701 aa9.79□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Npm1Q61937 292 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Fam13bQ8K2H3 851 aa9.79□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Erich6bQ9D4S6 220 aa9.78□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Cald1E9QA15 768 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 MsnP26041 577 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rsph3aQ3UFY4 516 aa9.78□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Lmtk2Q3TYD6 1471 aa9.77□□□□□ -0.84
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Zhx1P70121 873 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 BbxQ8VBW5 907 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Znf521Q6KAS7 1311 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Mug2P28666 1451 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rundc1Q0VDN7 615 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Plcd3Q8K2J0 785 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Grpel1Q99LP6 217 aa9.77□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Rock1P70335 1354 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Erich6D3Z6S9 713 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Ercc6lQ8BHK9 1240 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tmx3Q8BXZ1 456 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Tex14Q7M6U3 1450 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Setd1aE9PYH6 1716 aa9.76□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 Card11Q8CIS0 1159 aa9.75□□□□□ -0.85
Gm28718-201ENSMUST00000188417 RalgapbQ8BQZ4 1484 aa9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27 ms