RNA–Protein interactions for RNA: YKL050C

YKL050C, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKL050C, Length 2,769 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKL050C	YKL050C	SNF4	P12904	322 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	PRY2	P36110	329 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	RPS14B	P39516	138 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	PEX22	P39718	180 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YIL067C	P40514	678 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YJR015W	P47090	510 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	NKP2	Q06162	153 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	FDH1	Q08911	376 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	RPS1B	P23248	255 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	ATG22	P25568	528 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	PEX34	P25584	144 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	AHC2	P25649	128 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YBR137W	P38276	179 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	PGD1	P40356	397 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	PAN6	P40459	309 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	GLC8	P41818	229 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	GWT1	P47026	490 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	FLC3	P53121	802 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	RSC9	Q03124	581 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YMR181C	Q03231	154 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	SHH4	Q06236	168 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YOR214C	Q12282	236 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	MDM10	P18409	493 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	TRS65	P32893	560 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	SUI1	P32911	108 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	RFC2	P40348	353 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YFL064C	P43540	174 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	SAE3	P89114	91 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	APS2	Q00381	147 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YPR202W	Q08993	238 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	RDL1	Q12305	139 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.15	□□□□□ -1.9
YKL050C	YKL050C	CYC3	P06182	269 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	SEC4	P07560	215 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YMC1	P32331	307 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	LEU5	P38702	357 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	TRR2	P38816	342 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	COX14	P39103	70 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YER186C	P40101	306 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	ERJ5	P43613	295 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YGL034C	P53186	121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HST4	P53688	370 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	NRM1	P53718	249 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	FMN1	Q03778	218 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HRD1	Q08109	551 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HEM4	P06174	275 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HIS3	P06633	220 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PHA2	P32452	334 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	UGX2	P32772	223 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	SFK1	P35735	353 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YGP1	P38616	354 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	ARN2	P38724	620 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	MTC6	P38849	526 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PET8	P38921	284 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YGR017W	P53210	297 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	TRM12	Q04235	462 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	CNL1	Q06333	122 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	RTR2	Q12378	196 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PIS1	P06197	220 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	AQY1	P0CD91	305 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HRR25	P29295	494 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	MRP49	P32388	137 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
YKL050C	YKL050C	YEA4	P40004	342 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PEX17	P40155	199 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	BOR1	P53838	576 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YNL234W	P53857	426 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	SUR7	P54003	302 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YMR320W	Q04897	101 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	TRA1	P38811	3744 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	MSI1	P13712	422 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	ERD2	P18414	219 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	AGA1	P32323	725 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	TOD6	P34219	525 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	TIM13	P53299	105 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	HHT1	P61830	136 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	PET191	Q02772	108 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YDR124W	Q04608	324 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	FUN26	P31381	517 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YBR242W	P38331	238 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YGL101W	P53144	215 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	MRH4	P53166	561 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YKL050C	YKL050C	YNL046W	P53956	172 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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