RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	HOP2	P53187	214 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GET1	P53192	235 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YGR026W	P53217	278 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ABF2	Q02486	183 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YMR279C	Q03263	540 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	INM2	Q05533	292 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CDD1	Q06549	142 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YOR186W	Q08560	144 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GEP5	Q12393	293 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		0.89	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CDC33	P07260	213 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.88	□□□□□ -2.27	not detected
APL3	YBL037W	OST2	P46964	130 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GON7	P46984	123 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	BRR6	P53062	197 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YGL088W	P53151	121 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YGL034C	P53186	121 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CAB4	P53332	305 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PRM15	Q03262	622 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	EMI1	Q04406	187 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FAR8	Q05040	523 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MHT1	Q12525	324 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FKS3	Q04952	1785 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPS23B	P0CX30	145 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YER084W	P40057	128 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YER188W	P40103	239 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CAT5	P41735	233 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DSK2	P48510	373 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.88	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	HIS3	P06633	220 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ARG80	P07249	177 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ATG22	P25568	528 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ECM13	P38195	257 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YBR096W	P38256	230 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DOG2	P38773	246 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DOG1	P38774	246 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YIL001W	P40560	513 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MDM34	P53083	459 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ALG13	P53178	202 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GTR2	P53290	341 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YDR248C	Q03786	193 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ATG39	Q06159	398 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YOR097C	Q12274	175 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YPL247C	Q12523	523 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SPT3	P06844	337 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	RPO26	P20435	155 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MIG1	P27705	504 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YHL026C	P38740	315 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CPR7	P47103	393 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	OST3	P48439	350 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YGL159W	P53110	370 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PRM8	P53174	237 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SNZ1	Q03148	297 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YPR172W	Q06608	200 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CDC28	P00546	298 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SNA3	P14359	133 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	GCN3	P14741	305 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PTM1	P32857	523 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	APS1	P35181	156 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YKL075C	P36083	450 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MSA2	P36157	363 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YHR125W	P38831	101 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	IRC18	P47056	224 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CWC23	P52868	283 aa	Predicted RBP	0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YNL046W	P53956	172 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FEX1	Q08913	375 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FEX2	Q08991	375 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	TPO4	Q12256	659 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	AGC1	Q12482	902 aa		0.87	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	HKR1	P41809	1802 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PUT1	P09368	476 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	MER1	P16523	270 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	DBF2	P22204	572 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	CAF4	P36130	643 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YBR063C	P38083	404 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	IKI1	P38874	309 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SPO73	P40031	143 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YRB2	P40517	327 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	FAR7	P43592	221 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YJL144W	P47009	104 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	YJR056C	P47115	236 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	ERV29	P53337	310 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	PEX12	Q04370	399 aa		0.86	□□□□□ -2.27
APL3	YBL037W	SUE1	Q06524	206 aa		0.86	□□□□□ -2.27

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