RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ABLIM3	O94929	683 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CLTA	P09496	248 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CXCL8	P10145	99 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MYL4	P12829	197 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	GJB2	P29033	226 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNB1	Q02641	598 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MCL1	Q07820	350 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TWF1	Q12792	350 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	IL17A	Q16552	155 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MYCT1	Q8N699	235 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM161B	Q8NDZ6	487 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SECISBP2L	Q93073	1101 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM212A	Q96EL1	285 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	NTPCR	Q9BSD7	190 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	16	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TULP1	O00294	542 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	LRRN2	O75325	713 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	BMP15	O95972	392 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SCP2	P22307	547 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ABCD1	P33897	745 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MCM2	P49736	904 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	PPP2R5D	Q14738	602 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	HYI	Q5T013	277 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	GPBP1	Q86WP2	473 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	YAF2	Q8IY57	180 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DNASE1L2	Q92874	299 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	AK8	Q96MA6	479 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TRMT61B	Q9BVS5	477 aa	Known RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	15.99	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CACNA1H	O95180	2353 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MAN2B1	O00754	1011 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC26A4	O43511	780 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CD72	P21854	359 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ALDH1A3	P47895	512 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC12A3	P55017	1021 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SPAG1	Q07617	926 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	GRM2	Q14416	872 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC10A6	Q3KNW5	377 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	HAUS6	Q7Z4H7	955 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	BEST2	Q8NFU1	509 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	RUBCN	Q92622	972 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	IRF7	Q92985	503 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	BORCS6	Q96GS4	357 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	PNMA5	Q96PV4	448 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	PARVG	Q9HBI0	331 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	HEBP1	Q9NRV9	189 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	NCDN	Q9UBB6	729 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TRIO	O75962	3097 aa		15.98	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	OR6C75	A6NL08	312 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ABLIM1	O14639	778 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SPTLC1	O15269	473 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MICAL2	O94851	1124 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	SEC24A	O95486	1093 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	CYP3A5	P20815	502 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	EPHB3	P54753	998 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	NCKAP1L	P55160	1127 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	C8orf34	Q49A92	452 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TANGO2	Q6ICL3	276 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	TMX3	Q96JJ7	454 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	KIF2C	Q99661	725 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	GPR88	Q9GZN0	384 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	YIPF1	Q9Y548	306 aa		15.97	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	DPYSL4	O14531	572 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF263	O14978	683 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	OGT	O15294	1046 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	ODC1	P11926	461 aa		15.96	■□□□□ 0.15
TARDBP-231	ENST00000639599	GLUL	P15104	373 aa		15.96	■□□□□ 0.15

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