RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	TXLNG	Q9NUQ3	528 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM47DP	A6NHR8	397 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CST8	O60676	142 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	TOM1L1	O75674	476 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FSBP	O95073	299 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ANP32D	O95626	131 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	TTC4	O95801	387 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	LENG9	Q96B70	501 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FAF2	Q96CS3	445 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CAP2	P40123	477 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	HIF1A	Q16665	826 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CRY2	Q49AN0	593 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CNPY4	Q8N129	248 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MKL1	Q969V6	931 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM81B	Q96LP2	452 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRC4C	Q9HCJ2	640 aa		12.45	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GYG2	O15488	501 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	EDIL3	O43854	480 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	PPFIA2	O75334	1257 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT4	P19013	534 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RGS7	P49802	495 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FMO1	Q01740	532 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NFX1	Q12986	1120 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP2R5C	Q13362	524 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	AKT1S1	Q96B36	256 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF302	Q9NR11	478 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	UBE4B	O95155	1302 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CIB2	O75838	187 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	GZMA	P12544	262 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CIITA	P33076	1130 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	TMPRSS15	P98073	1019 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SPIRE1	Q08AE8	756 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NME8	Q8N427	588 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRN4	Q8WUT4	740 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	KCND2	Q9NZV8	630 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	AKT3	Q9Y243	479 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SPDYE6	P0CI01	402 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ARL4C	P56559	192 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CCNY	Q8ND76	341 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	TRIM6	Q9C030	488 aa	Predicted RBP	12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MIS12	Q9H081	205 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	PARVA	Q9NVD7	372 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DISP2	A7MBM2	1401 aa		12.44	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ENO4	A6NNW6	628 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525		H0YCG3	227 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DGAT1	O75907	488 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT3	P12035	628 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	VCAM1	P19320	739 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SSTR1	P30872	391 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	SFN	P31947	248 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FNTA	P49354	379 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	COPS2	P61201	443 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	STAT4	Q14765	748 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	ICAM1	P05362	532 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CYP3A4	P08684	503 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CDH6	P55285	790 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	PDE1B	Q01064	536 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	CHADL	Q6NUI6	762 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	LONP2	Q86WA8	852 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		12.43	□□□□□ -0.42
SPIN3-223	ENST00000639525	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.43	□□□□□ -0.42

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