RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635997.1

NEDD4L-238, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 5 BASIC

Gene NEDD4L, Length 4,402 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEDD4L-238	ENST00000635997	PDGFRA	P16234	1089 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	FGFR4	P22455	802 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GIT2	Q14161	759 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		15.16	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PLCB4	Q15147	1175 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC18A3	Q16572	532 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CES5A	Q6NT32	575 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	HPSE	Q9Y251	543 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	MRC1	P22897	1456 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STRC	Q7RTU9	1775 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	B3GAT3	O94766	335 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGB3	P05106	788 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PPP1R2P3	Q6NXS1	205 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	OSMR	Q99650	979 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC78	A2IDD5	438 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	RASGRF2	O14827	1237 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TGFB3	P10600	412 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CTNNB1	P35222	781 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCZ1B	P86790	482 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	TFDP2	Q14188	446 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNK18	Q7Z418	384 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	STMN2	Q93045	179 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	ZNF560	Q96MR9	790 aa		15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	15.15	■□□□□ 0.02
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A087WUV0	522 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A087WZ62	844 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	PEX10	O60683	326 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	TROVE2	P10155	538 aa	Known RBP eCLIP	15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	GRIK1	P39086	918 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	AP5Z1	O43299	807 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	GMNN	O75496	209 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCNA3	P22001	575 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	PEX19	P40855	299 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	METTL7B	Q6UX53	244 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	TNIP3	Q96KP6	325 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CERS4	Q9HA82	394 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997		A0A087X0B3	334 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CA4	P22748	312 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	RFC5	P40937	340 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	PGM5	Q15124	567 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	BTBD8	Q5XKL5	378 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SEPT4	O43236	478 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	PMS1	P54277	932 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	APPL2	Q8NEU8	664 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		15.14	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	AKAP3	O75969	853 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	MT-ND3	P03897	115 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	INSRR	P14616	1297 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	ITGA7	Q13683	1181 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	HASPIN	Q8TF76	798 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	BHMT	Q93088	406 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	KCND2	Q9NZV8	630 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CPSF2	Q9P2I0	782 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC188	H7C350	402 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	ASAP2	O43150	1006 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	MAP3K6	O95382	1288 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	NDUFV1	P49821	464 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	APBA1	Q02410	837 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	TLE2	Q04725	743 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	NNT	Q13423	1086 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SLMAP	Q14BN4	828 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	FIBCD1	Q8N539	461 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	EXT2	Q93063	718 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	HDAC11	Q96DB2	347 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CPB2	Q96IY4	423 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	AGAP3	Q96P47	875 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	CCDC160	A6NGH7	325 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	GTF2H1	P32780	548 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	GPS1	Q13098	491 aa		15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
NEDD4L-238	ENST00000635997	SMTNL2	Q2TAL5	461 aa		15.13	■□□□□ 0.01

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