RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623028.1

VGLL4-218, Transcript of vestigial like family member 4, humanhuman

TSL 5

Gene VGLL4, Length 728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4-218ENST00000623028 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.4■□□□□ 0.86
VGLL4-218ENST00000623028 MTRRQ9UBK8 725 aa20.4■□□□□ 0.86
VGLL4-218ENST00000623028 DOCK6Q96HP0 2047 aa20.39■□□□□ 0.86
VGLL4-218ENST00000623028 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 LILRA6Q6PI73 481 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 BRSK2Q8IWQ3 736 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 EXOC1Q9NV70 894 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PRKAG3Q9UGI9 489 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 USP25Q9UHP3 1055 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CDY1Q9Y6F8 540 aa20.39■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PTPRJQ12913 1337 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C19orf67A6NJJ6 358 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CLIC2O15247 247 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 SPTLC1O15269 473 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TRAPPC3O43617 180 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 EXTL3O43909 919 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CYP3A5P20815 502 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 OR1D2P34982 312 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 STK4Q13043 487 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CBWD2Q8IUF1 395 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 GPR65Q8IYL9 337 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 BEST2Q8NFU1 509 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 SUSD3Q96L08 255 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ASB7Q9H672 318 aa20.38■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 UBE4BO95155 1302 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ZNF202O95125 648 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RPN1P04843 607 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CREMQ03060 361 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ITIH3Q06033 890 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C9orf57Q5W0N0 161 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CES5AQ6NT32 575 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CD302Q8IX05 232 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 GPD1LQ8N335 351 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 KREMEN2Q8NCW0 462 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PDE11AQ9HCR9 933 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.37■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 XPOTO43592 962 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CYP2J2P51589 502 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ARPP19P56211 112 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 DPYDQ12882 1025 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 BMT2Q1RMZ1 405 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 GPR149Q86SP6 731 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 DPP3Q9NY33 737 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 FBXW11Q9UKB1 542 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PCDHB8Q9UN66 801 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 DERAQ9Y315 318 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C2CD2Q9Y426 696 aa20.36■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ANO9A1A5B4 782 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 SYN3O14994 580 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 IL18RAPO95256 599 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ANKS3Q6ZW76 656 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 FBXL5Q9UKA1 691 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 BACE2Q9Y5Z0 518 aa20.35■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 M0QZQ0 153 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PIRO00625 290 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TBC1D4O60343 1298 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 LDHAP00338 332 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ROR1Q01973 937 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RAB33AQ14088 237 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PDXDC1Q6P996 788 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C1orf127Q8N9H9 656 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RDH13Q8NBN7 331 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 RIPOR3Q96MK2 946 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 TSPAN18Q96SJ8 248 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 MTMR12Q9C0I1 747 aa20.34■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 WDR27A2RRH5 827 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C2CD4DB7Z1M9 353 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 C8AP07357 584 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 MTHFRP42898 656 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 LILRA4P59901 499 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 PNOCQ13519 176 aa20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
VGLL4-218ENST00000623028 ENGASEQ8NFI3 743 aa20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms