RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622090.4

DDB2-215, Transcript of damage specific DNA binding protein 2, human

TSL 5

Gene DDB2, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DDB2-215	ENST00000622090	ATF2	P15336	505 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	FGD1	P98174	961 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	SOX4	Q06945	474 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	UPP1	Q16831	310 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	POTED	Q86YR6	584 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	TPH2	Q8IWU9	490 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	LHX6	Q9UPM6	363 aa		13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	ASCC3	Q8N3C0	2202 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
DDB2-215	ENST00000622090	LRRIQ4	A6NIV6	560 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SOBP	A7XYQ1	873 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	EPHA5	P54756	1037 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ITPR1	Q14643	2758 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	BSND	Q8WZ55	320 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FZD8	Q9H461	694 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		13.77	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	C4orf47	A7E2U8	309 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CHAD	O15335	359 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DGAT1	O75907	488 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ELF1	P32519	619 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	RARRES1	P49788	294 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TNK2	Q07912	1038 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FCHO2	Q0JRZ9	810 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TWF1	Q12792	350 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SH3PXD2A	Q5TCZ1	1133 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	EIF2AK1	Q9BQI3	630 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	EDEM2	Q9BV94	578 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LRRC3	Q9BY71	257 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	C8orf33	Q9H7E9	229 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LAMA5	O15230	3695 aa		13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	N4BP3	O15049	544 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	VNN2	O95498	520 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC192	P0DO97	292 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FAM187B	Q17R55	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PLK5	Q496M5	336 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	EARS2	Q5JPH6	523 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TMC8	Q8IU68	726 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	MSANTD3	Q96H12	275 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TSC2	P49815	1807 aa		13.75	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090		A0A1W2PRU2	124 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LNP1	A1A4G5	178 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DCLK1	O15075	740 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	DTNB	O60941	627 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	LYPLA2	O95372	231 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KRT32	Q14532	448 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	NEK8	Q86SG6	692 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SKAP1	Q86WV1	359 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	YAF2	Q8IY57	180 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	CHFR	Q96EP1	664 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	HSD17B14	Q9BPX1	270 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	SLITRK6	Q9H5Y7	841 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	ASAH2	Q9NR71	780 aa		13.74	□□□□□ -0.21
DDB2-215	ENST00000622090	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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