RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614794.4

SPPL2B-211, Transcript of signal peptide peptidase like 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPPL2B, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2B-211ENST00000614794 TRPC3Q13507 836 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 CBWD6Q4V339 395 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 CBWD3Q5JTY5 395 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 MIIPQ5JXC2 388 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 CBWD5Q5RIA9 395 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 RABGGTAQ92696 567 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 NDST4Q9H3R1 872 aa24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 P4HA2O15460 535 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 PBX3P40426 434 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 CETN1Q12798 172 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 NCOA4Q13772 614 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 GBF1Q92538 1859 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 RBSNQ9H1K0 784 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.08■■□□□ 1.45
SPPL2B-211ENST00000614794 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PES1O00541 588 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 CST3P01034 146 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 DNAJB2P25686 324 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PPM1AP35813 382 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 BMPR1AP36894 532 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PNPLA4P41247 253 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 COPB1P53618 953 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 MYL7Q01449 175 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 LRRC52Q8N7C0 313 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 FBXL13Q8NEE6 735 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 VPS16Q9H269 839 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.08■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PPEF2O14830 753 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGEF15O94989 841 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 VNN1O95497 513 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TAP1Q03518 808 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TAS1R2Q8TE23 839 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TIFAQ96CG3 184 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF560Q96MR9 790 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SAMD11Q96NU1 681 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PLVAPQ9BX97 442 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SPG21Q9NZD8 308 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 COQ4Q9Y3A0 265 aa24.07■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TADA2AO75478 443 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF4AO95239 1232 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 HLA-DRAP01903 254 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PAX3P23760 479 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 PIK3CAP42336 1068 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 LILRA4P59901 499 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 MYO1EQ12965 1108 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SCARA3Q6AZY7 606 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SLC39A11Q8N1S5 342 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 C3orf58Q8NDZ4 430 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 IGSF21Q96ID5 467 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 HPDLQ96IR7 371 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ADAM28Q9UKQ2 775 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 NUB1Q9Y5A7 615 aa24.06■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SERPINC1P01008 464 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ATICP31939 592 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 CTNNB1P35222 781 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TAF6P49848 677 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 MYL6P60660 151 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 C17orf80Q9BSJ5 609 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 MARCH5Q9NX47 278 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 RAB20Q9NX57 234 aa24.05■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 F8W810 466 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 RB1P06400 928 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ERVK-21P61565 698 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SV2CQ496J9 727 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 CCDC150Q8NCX0 1101 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 HASPINQ8TF76 798 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TAF4BQ92750 862 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TMEM169Q96HH4 297 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.04■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 LGALS16A8MUM7 142 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 C5orf67F2Z3F1 127 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 TRAPPC3O43617 180 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 STAU1O95793 577 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ITGB1P05556 798 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 FANCCQ00597 558 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 FILIP1LQ4L180 1135 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 EPC2Q52LR7 807 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 FKBP15Q5T1M5 1219 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 CD300LGQ6UXG3 332 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SEMA4DQ92854 862 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 XYLT2Q9H1B5 865 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 MTUS1Q9ULD2 1270 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 SCN1AP35498 2009 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 KPNA7A9QM74 516 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ASS1P00966 412 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 KRT17Q04695 432 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF699Q32M78 642 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 GBP6Q6ZN66 633 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 KLHL23Q8NBE8 558 aa24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
SPPL2B-211ENST00000614794 VRTNQ9H8Y1 702 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms