RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613394.4

HPS1-215, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HPS1, Length 3,714 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-215ENST00000613394 MCEEQ96PE7 176 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 GGA2Q9UJY4 613 aa14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MYH11P35749 1972 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 MARK3P27448 753 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 DRG2P55039 364 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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HPS1-215ENST00000613394 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 SCYL2Q6P3W7 929 aa14.63□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
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HPS1-215ENST00000613394 EP400Q96L91 3159 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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HPS1-215ENST00000613394 C5orf60A6NFR6 353 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 F5H423 210 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 JAK3P52333 1124 aa14.61□□□□□ -0.07
HPS1-215ENST00000613394 FITM2Q8N6M3 262 aa14.61□□□□□ -0.07
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