RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600209.5

FCHO1-232, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5

Gene FCHO1, Length 881 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-232ENST00000600209 TSPY26PQ9H489 355 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 MTUS1Q9ULD2 1270 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TRAPPC3O43617 180 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 PHACTR2O75167 634 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 KIF4AO95239 1232 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 EFEMP2O95967 443 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 CST3P01034 146 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 ITGB1P05556 798 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 PNPLA4P41247 253 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 GCLMP48507 274 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 GPM6BQ13491 265 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 KRT39Q6A163 491 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 CREBRFQ8IUR6 639 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 SPPL3Q8TCT6 385 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 CERS4Q9HA82 394 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 SIX4Q9UIU6 781 aa21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 BECN2A8MW95 431 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 KCNJ18B7U540 433 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 PMM2O15305 246 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 KRT19P08727 400 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 LILRA4P59901 499 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 BIRC3Q13489 604 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 KCNJ12Q14500 433 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF697Q5TEC3 545 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 C3orf58Q8NDZ4 430 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 FAM84AQ96KN4 292 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF560Q96MR9 790 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 CBX8Q9HC52 389 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.58■■□□□ 1.05
FCHO1-232ENST00000600209 F8W810 466 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 PPEF2O14830 753 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 ATICP31939 592 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TAF6P49848 677 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 KCNH2Q12809 1159 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TRPC3Q13507 836 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TCP11X2Q5H9J9 407 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 FUT10Q6P4F1 479 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 FAM200AQ8TCP9 573 aa21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 44.6
FCHO1-232ENST00000600209 P4HA2O15460 535 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 VNN1O95497 513 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 STAU1O95793 577 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 ZNF18P17022 549 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 FMO5P49326 533 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.043e-6■■■■■ 61.8
FCHO1-232ENST00000600209 MXI1P50539 228 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 MYO1EQ12965 1108 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 MAN2A1Q16706 1144 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SV2CQ496J9 727 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 HASPINQ8TF76 798 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 POF1BQ8WVV4 589 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SUSD3Q96L08 255 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 LMAN2LQ9H0V9 348 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 HSD3B7Q9H2F3 369 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.56■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 KPNA7A9QM74 516 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 GRM6O15303 877 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SOD2P04179 222 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 BRCC3P46736 316 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 NCOA4Q13772 614 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 SCARA3Q6AZY7 606 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 TAF4BQ92750 862 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 HPDLQ96IR7 371 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 VWA8A3KMH1 1905 aa21.55■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 ARHGEF37A1IGU5 675 aa21.54■■□□□ 1.04
FCHO1-232ENST00000600209 EPOPA6NHQ4 379 aa21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms