RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599231.5

STRN4-217, Transcript of striatin 4, humanhuman

TSL 2

Gene STRN4, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4-217ENST00000599231 EOMESO95936 686 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CST3P01034 146 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FGFR1P11362 822 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 UCHL3P15374 230 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ADKP55263 362 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TRPC3Q13507 836 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NAB2Q15742 525 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TC2NQ8N9U0 490 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 HELQQ8TDG4 1101 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 BAP1Q92560 729 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NT5C1BQ96P26 610 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 UBN1Q9NPG3 1134 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 MIOSQ9NXC5 875 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SCN1AP35498 2009 aa14.61□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PPEF2O14830 753 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 OFD1O75665 1012 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ASS1P00966 412 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 KRT19P08727 400 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TPM1P09493 284 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ACRP10323 421 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GATMP50440 423 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GSDMDP57764 484 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 IKBKEQ14164 716 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ZNF699Q32M78 642 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PDXDC1Q6P996 788 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GLB1LQ6UWU2 654 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 BADQ92934 168 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 KAT5Q92993 513 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TATDN2Q93075 761 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 EDEM3Q9BZQ6 932 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 IL23AQ9NPF7 189 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FBXL5Q9UKA1 691 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 DNAJC12Q9UKB3 198 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CLSTN1O94985 981 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 POMCP01189 267 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PFKMP08237 780 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CYP3A5P20815 502 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RFX1P22670 979 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 KRT9P35527 623 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 JAM2P57087 298 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RBP5P82980 135 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ZBED6P86452 979 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 FPGSQ05932 587 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GRIK3Q13003 919 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RAPGEF1Q13905 1077 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SHHQ15465 462 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 WDR44Q5JSH3 913 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RRAGAQ7L523 313 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 GPIHBP1Q8IV16 184 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CNGA4Q8IV77 575 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PPM1KQ8N3J5 372 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 KREMEN1Q96MU8 473 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 IMPG2Q9BZV3 1241 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 SLC38A7Q9NVC3 462 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 CACNG4Q9UBN1 327 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 NUB1Q9Y5A7 615 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 TSC2P49815 1807 aa14.59□□□□□ -0.07
STRN4-217ENST00000599231 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 ANO9A1A5B4 782 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 LRRC53A6NM62 1247 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 THP07101 528 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 LRPAP1P30533 357 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.082e-6■□□□□ 10.3
STRN4-217ENST00000599231 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 NOMO2Q5JPE7 1267 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 URGCPQ8TCY9 931 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 TAF4BQ92750 862 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 DNAJC7Q99615 494 aa14.58□□□□□ -0.08
STRN4-217ENST00000599231 ARID3AQ99856 593 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms