RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594708.1

SMC5-AS1-201, Transcript of SMC5 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMC5-AS1, Length 1,818 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ITGA11Q9UKX5 1188 aa21.11■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AGAP1Q9UPQ3 857 aa21.11■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIRO00625 290 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VNN1O95497 513 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RPL9P32969 192 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CTNNB1P35222 781 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BMPR1AP36894 532 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT31Q15323 416 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 CD300LGQ6UXG3 332 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM8AQ9HCN3 771 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AAASQ9NRG9 546 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAB2Q9NYJ8 693 aa21.1■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PHACTR2O75167 634 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GTF2H1P32780 548 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MIIPQ5JXC2 388 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SLC39A11Q8N1S5 342 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYO9BQ13459 2157 aa21.09■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 STX10O60499 249 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRN2O75325 713 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 AFPP02771 609 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FMO5P49326 533 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MXI1P50539 228 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MAN2A1Q16706 1144 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EPC2Q52LR7 807 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KRT39Q6A163 491 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAS1R2Q8TE23 839 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COLEC11Q9BWP8 271 aa21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ERVK-21P61565 698 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBP5P82980 135 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 IGSF21Q96ID5 467 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RBSNQ9H1K0 784 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VPS16Q9H269 839 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPG21Q9NZD8 308 aa21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SZT2Q5T011 3432 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPTLC1O15269 473 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TADA2AO75478 443 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 BRCC3P46736 316 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYL6P60660 151 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TRPC3Q13507 836 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NCOA4Q13772 614 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VWA3BQ502W6 1294 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ADAM28Q9UKQ2 775 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RWDD3Q9Y3V2 267 aa21.07■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 I3L4J1 428 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FGF18O76093 207 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HLA-DRAP01903 254 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LILRA4P59901 499 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TPM4P67936 248 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ARNTL2Q8WYA1 636 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SEMA4DQ92854 862 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRCH3Q96II8 777 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NDST4Q9H3R1 872 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 NUB1Q9Y5A7 615 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 C5orf67F2Z3F1 127 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PIK3CAP42336 1068 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COPB1P53618 953 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 MYL7Q01449 175 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TMEM169Q96HH4 297 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 HPDLQ96IR7 371 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PI4K2AQ9BTU6 479 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 VN1R3Q9BXE9 311 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 GPR62Q9BZJ7 368 aa21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.06■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PPM1AP35813 382 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAF6P49848 677 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TIGD5Q53EQ6 642 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC52Q8N7C0 313 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FBXL13Q8NEE6 735 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SAMD11Q96NU1 681 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PLVAPQ9BX97 442 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 XYLT2Q9H1B5 865 aa21.05■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 EPOPA6NHQ4 379 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 FUT10Q6P4F1 479 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 TAS1R1Q7RTX1 841 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RAB20Q9NX57 234 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 COQ4Q9Y3A0 265 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 RB1P06400 928 aa21.04■□□□□ 0.96
SMC5-AS1-201ENST00000594708 PNPLA4P41247 253 aa21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms