RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589550.1

PIK3C3-211, Transcript of phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

TSL 3

Gene PIK3C3, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF792Q3KQV3 632 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KRBA2Q6ZNG9 492 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 MICU3Q86XE3 530 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TTLL6Q8N841 843 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM71BQ8TC56 605 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 C18orf8Q96DM3 657 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CFAP97Q9P2B7 532 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.25□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 NRP1O14786 923 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 HMGCRP04035 888 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PFKLP17858 780 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 VIPR1P32241 457 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PTPN7P35236 360 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KIR2DL3P43628 341 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KCNQ1P51787 676 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 MXRA7P84157 204 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FOXO4P98177 505 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 DUSP2Q05923 314 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KIF22Q14807 665 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC93Q567U6 631 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PRSS36Q5K4E3 855 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM68Q6AZZ1 485 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RTKN2Q8IZC4 609 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KYQ8NBH2 561 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF384Q8TF68 577 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 GDF15Q99988 308 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 GJB4Q9NTQ9 266 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CROTQ9UKG9 612 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CRYL1Q9Y2S2 319 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ITIH6Q6UXX5 1313 aa6.24□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM234BA2RU67 622 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 KLHL18O94889 574 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 GNAI2P04899 355 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ITGA5P08648 1049 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 IDEP14735 1019 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FPR1P21462 350 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 MC3RP41968 323 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RXRGP48443 463 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 MEOX1P50221 254 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 POLE2P56282 527 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RAB30Q15771 203 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FBXO47Q5MNV8 452 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RETSATQ6NUM9 610 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 UNC13DQ70J99 1090 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 NBPF11Q86T75 865 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CCDC150Q8NCX0 1101 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 IL17RDQ8NFM7 739 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 EID2BQ96D98 161 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 GORASP1Q9BQQ3 440 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 EYA2O00167 538 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TRIM38O00635 465 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 GRM6O15303 877 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 CTBP1Q13363 440 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 EFR3AQ14156 821 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 RTP5Q14D33 572 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 TAF5Q15542 800 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 PDSS2Q86YH6 399 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 YAF2Q8IY57 180 aa6.22□□□□□ -1.41
PIK3C3-211ENST00000589550 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.22□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms