RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 SPIRE2Q8WWL2 714 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LRRC45Q96CN5 670 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HAUS1Q96CS2 278 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 C1orf112Q9NSG2 853 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 BTBD7Q9P203 1132 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PYGBP11216 843 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R7Q15435 360 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 QPCTQ16769 361 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HHATQ5VTY9 493 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DEPTORQ8TB45 409 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 NSMCE1Q8WV22 266 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZNF302Q9NR11 478 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ADM5C9JUS6 153 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DGAT1O75907 488 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 VNN1O95497 513 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PTGIRP43119 386 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MTA1Q13330 715 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GNPTABQ3T906 1256 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MREGQ8N565 214 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KIFAP3Q92845 792 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 COPS5Q92905 334 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KLRG1Q96E93 195 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MSTO1Q9BUK6 570 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GRHL1Q9NZI5 618 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZNF232Q9UNY5 417 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CD2APQ9Y5K6 639 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CES2O00748 559 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 IFNAR2P48551 515 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 STRN3Q13033 797 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LAMB3Q13751 1172 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DCAF15Q66K64 600 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MFSD14AQ96MC6 490 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 EPB41L4BQ9H329 900 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 AZI2Q9H6S1 392 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 C10orf88Q9H8K7 445 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DDNO94850 711 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 WEE2P0C1S8 567 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KRT10P13645 584 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GPC3P51654 580 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ALCAMQ13740 583 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CAPN12Q6ZSI9 719 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 FUKQ8N0W3 1084 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MGARPQ8TDB4 240 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GPRASP2Q96D09 838 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 OTUD5Q96G74 571 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.02■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HGSO14964 777 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 PIAS1O75925 651 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 CREB1P16220 341 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 ANXA13P27216 316 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 VGLL4Q14135 290 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 DPH6Q7L8W6 267 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 THNSL1Q8IYQ7 743 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 IWS1Q96ST2 819 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 MTFR1LQ9H019 292 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 RNF19AQ9NV58 838 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.02■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 PHF2O75151 1096 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 PMS2P54278 862 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R40P59535 323 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 IGBP1P78318 339 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 PTGISQ16647 500 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 ACAD10Q6JQN1 1059 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 RUBCNQ92622 972 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 MROH7Q68CQ1 1323 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 THAP12O43422 761 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 CHKAP35790 457 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 LRRC14Q15048 493 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 LONRF1Q17RB8 773 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.01■□□□□ 0.15
CTIF-205ENST00000587860 SGO2Q562F6 1265 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.2 ms