RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP17.59■□□□□ 0.41
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RARGP13631 454 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PPIL2Q13356 520 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SCARA3Q6AZY7 606 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TRIM50Q86XT4 487 aa17.55■□□□□ 0.4
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RHOT1Q8IXI2 618 aa17.55■□□□□ 0.4
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