RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYFIP2Q96F07 1278 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CCDC113Q9H0I3 377 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNPEPQ9H4A4 650 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 COG5Q9UP83 839 aa25.76■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAPPC3O43617 180 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPFIA2O75334 1257 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRKCBP05771 671 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CLCN3P51790 818 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP2R2AP63151 447 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGBP1P78318 339 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EXOC8Q8IYI6 725 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NLRP4Q96MN2 994 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HBP1O60381 514 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PAEPP09466 180 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CYP11B1P15538 503 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TMOD1P28289 359 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PDE6CP51160 858 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZPBP2Q6X784 338 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERVK-5Q9HDB9 667 aa25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GMNCA6NCL1 334 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFSF9P41273 254 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FKBP1BP68106 108 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMO1Q01740 532 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GCNT1Q02742 428 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAPK6Q16659 721 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 WDR44Q5JSH3 913 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DUPD1Q68J44 220 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPOPLQ6IQ16 392 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C3orf20Q8ND61 904 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RRAGCQ9HB90 399 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERAP1Q9NZ08 941 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MORF4L1Q9UBU8 362 aa25.74■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VNN1O95497 513 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CALCAP01258 141 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CGRRF1Q99675 332 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VTA1Q9NP79 307 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TOM1L1O75674 476 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LGALS2P05162 132 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPARDQ03181 441 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LAMC2Q13753 1193 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPDYCQ5MJ68 293 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRYD7Q5W111 196 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR142Q7Z601 462 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DPP9Q86TI2 863 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ALG3Q92685 438 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FMO2Q99518 471 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAB17Q9H0T7 212 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa25.73■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 STRNO43815 780 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RTN2O75298 545 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GH1P01241 217 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OR5B17Q8NGF7 314 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PTPN18Q99952 460 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRIM31Q9BZY9 425 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DR1Q01658 176 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AFG1LQ8WV93 481 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ERP44Q9BS26 406 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C2orf40Q9H1Z8 148 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP25.72■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF286BP0CG31 522 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDR2Q01850 454 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IFT88Q13099 833 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PPP2R5EQ16537 467 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRT71Q3SY84 523 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TLCD1Q96CP7 247 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HADHBP55084 474 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 QPCTQ16769 361 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RAPGEF5Q92565 580 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 FAM212AQ96EL1 285 aa25.71■■□□□ 1.71
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27 ms