RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576932.5

TOM1L1-223, Transcript of target of myb1 like 1 membrane trafficking protein, human

TSL 1 (best)

Gene TOM1L1, Length 1,252 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1L1-223	ENST00000576932	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	LONP2	Q86WA8	852 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	KSR1	Q8IVT5	923 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	HACE1	Q8IYU2	909 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	STK32A	Q8WU08	396 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCDC12	Q8WUD4	166 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC5A5	Q92911	643 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	MSANTD3	Q96H12	275 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	LOXL4	Q96JB6	756 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	INSM2	Q96T92	566 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	C6orf50	Q9HD87	102 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	NOTCH4	Q99466	2003 aa		10.28	□□□□□ -0.76
TOM1L1-223	ENST00000576932	IGF2R	P11717	2491 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932		F8W810	466 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CCL16	O15467	120 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ASAP2	O43150	1006 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMD10	O75832	226 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF806	P0C7X5	589 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GNA11	P29992	359 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCNN1G	P51170	649 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	USP11	P51784	963 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	NCBP1	Q09161	790 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GRIK3	Q13003	919 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RTN1	Q16799	776 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FAM3C	Q92520	227 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	IRF7	Q92985	503 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZFP42	Q96MM3	310 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MIOS	Q9NXC5	875 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	POLI	Q9UNA4	740 aa		10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHMP2A	O43633	222 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TADA2A	O75478	443 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MICAL2	O94851	1124 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ERLIN2	O94905	339 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCNK5	O95279	499 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHRNB1	P11230	501 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SATB1	Q01826	763 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	RAB33A	Q14088	237 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMD5	Q16401	504 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TTC22	Q5TAA0	569 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ANO5	Q75V66	913 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	KCTD17	Q8N5Z5	321 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SLC7A14	Q8TBB6	771 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL26A1	Q96A83	441 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PLA2G2F	Q9BZM2	168 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CSRNP2	Q9H175	543 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DHX33	Q9H6R0	707 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	BRD9	Q9H8M2	597 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	SCHIP1	Q9P0W5	487 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	COL4A2	P08572	1712 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	TMEM150B	A6NC51	233 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932		K7ESF4	209 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZBTB43	O43298	467 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	MAN1A2	O60476	641 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	C1QTNF9	P0C862	333 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FCAR	P24071	287 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	FNTB	P49356	437 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	PSMC5	P62195	406 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	POU5F1B	Q06416	359 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	LRRC32	Q14392	662 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932		Q4G0T1	1027 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TOM1L1-223	ENST00000576932	STPG1	Q5TH74	334 aa		10.25	□□□□□ -0.77

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