RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	CHRNB1	P11230	501 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GDI1	P31150	447 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MCM7	P33993	719 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GRM5	P41594	1212 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CXCL12	P48061	93 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	EPHA5	P54756	1037 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ARPP19	P56211	112 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	HS6ST3	Q8IZP7	471 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CEP120	Q8N960	986 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	NETO1	Q8TDF5	533 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	IFT74	Q96LB3	600 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CDT1	Q9H211	546 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	POLD4	Q9HCU8	107 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CACNA1G	O43497	2377 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	NCAN	O14594	1321 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169		K7ERI5	159 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ARNTL	O00327	626 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PODXL	O00592	558 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	KCNE1	P15382	129 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MUT	P22033	750 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	VIPR2	P41587	438 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SATB1	Q01826	763 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GAS6	Q14393	721 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD1	Q15327	319 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ME3	Q16798	604 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	IQCE	Q6IPM2	695 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	LEMD2	Q8NC56	503 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ERMN	Q8TAM6	284 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	KIFAP3	Q92845	792 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF512	Q96ME7	567 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ACO2	Q99798	780 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CEP72	Q9P209	647 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MAFF	Q9ULX9	164 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	USP24	Q9UPU5	2620 aa		12.48	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF263	O14978	683 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	HR	O43593	1189 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GJA1	P17302	382 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CCNE1	P24864	410 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CSRP2	Q16527	193 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ECM1	Q16610	540 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PPM1J	Q5JR12	505 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ELMOD1	Q8N336	334 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	GTF3C6	Q969F1	213 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		12.47	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PHLPP2	Q6ZVD8	1323 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169		K7ESF4	209 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ABLIM1	O14639	778 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	LARGE1	O95461	756 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	OR52Z1	P0C646	297 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MYL4	P12829	197 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	CNR2	P34972	360 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	FNTB	P49356	437 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	FOSB	P53539	338 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	OSTN	P61366	133 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	DMWD	Q09019	674 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TWF1	Q12792	350 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PTGDR	Q13258	359 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM29	Q14134	588 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF280D	Q6N043	979 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	E2F7	Q96AV8	911 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	MSANTD3	Q96H12	275 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	ACAP3	Q96P50	834 aa		12.46	□□□□□ -0.41
TCF4-238	ENST00000568169	TARS2	Q9BW92	718 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41

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