RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558843.5

COPS2-205, Transcript of COP9 signalosome subunit 2, human

TSL 1 (best)

Gene COPS2, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS2-205	ENST00000558843	CMIP	Q8IY22	773 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	GSTO2	Q9H4Y5	243 aa		5.19	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843		A0A1W2PS29	197 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MTHFD2	P13995	350 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MCAM	P43121	646 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	SOX10	P56693	466 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	DHCR24	Q15392	516 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	KCNK18	Q7Z418	384 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	LPIN2	Q92539	896 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	INTS13	Q9NVM9	706 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	AOX1	Q06278	1338 aa		5.18	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843		A0A087X0B3	334 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ADM5	C9JUS6	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PDE8A	O60658	829 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MGAT2	Q10469	447 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MALL	Q13021	153 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ANO4	Q32M45	955 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TOR2A	Q5JU69	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ORAI2	Q96SN7	254 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		5.17	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	LINC00473	A8K010	186 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TP73	O15350	636 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PRAMEF10	O60809	474 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	AMY1A	P04745	511 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	CHRM2	P08172	466 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	PTPRR	Q15256	657 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	TXNRD1	Q16881	649 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MTX3	Q5HYI7	312 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	MAPRE3	Q9UPY8	281 aa		5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
COPS2-205	ENST00000558843	ZEB2	O60315	1214 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	HAUS5	O94927	633 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KCNA2	P16389	499 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	GATA3	P23771	443 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SSBP2	P81877	361 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZBTB9	Q96C00	473 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PGBD1	Q96JS3	809 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TTC1	Q99614	292 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		5.15	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KCNAB3	O43448	404 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PTGER1	P34995	402 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CREM	Q03060	361 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	FPGS	Q05932	587 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF626	Q68DY1	528 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	HAPLN3	Q96S86	360 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CDYL	Q9Y232	598 aa		5.14	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	BMP15	O95972	392 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	PRR35	P0CG20	571 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DDC	P20711	480 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SLC6A4	P31645	630 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	SCAND1	P57086	179 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	TFF2	Q03403	129 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	GRM1	Q13255	1194 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	FAM153C	Q494X1	144 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	DACT2	Q5SW24	774 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	FCRL4	Q96PJ5	515 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	CTTNBP2NL	Q9P2B4	639 aa		5.13	□□□□□ -1.59
COPS2-205	ENST00000558843	USP35	Q9P2H5	1018 aa		5.13	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms