RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 S1PR5Q9H228 398 aa22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.69■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 DLL1O00548 723 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PPEF2O14830 753 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 RHOBTB3O94955 611 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 GLUD1P00367 558 aa22.68■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 PDXDC1Q6P996 788 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 CBWD2Q8IUF1 395 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SUSD3Q96L08 255 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 VWA8A3KMH1 1905 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 ANK1P16157 1881 aa22.68■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 CLIC2O15247 247 aa22.67■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 CYP2J2P51589 502 aa22.67■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PNOCQ13519 176 aa22.67■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PALB2Q86YC2 1186 aa22.67■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 MTRRQ9UBK8 725 aa22.67■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SYN3O14994 580 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 ADAM12O43184 909 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 KCNB1Q14721 858 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SUSD6Q92537 303 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PDE11AQ9HCR9 933 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 MAN1C1Q9NR34 630 aa22.66■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 DPP3Q9NY33 737 aa22.66■■□□□ 1.22
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TMOD3-203ENST00000558455 ZNF233A6NK53 670 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SPDYE4A6NLX3 237 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 TGM5O43548 720 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA31D3P0C874 917 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 FAM84AQ96KN4 292 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 TIGD1Q96MW7 591 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 ADAM7Q9H2U9 754 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 KCTD10Q9H3F6 313 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 SFXN1Q9H9B4 322 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA1586Q9HCI6 787 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 CDH22Q9UJ99 828 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 PCDHB8Q9UN66 801 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 BACE2Q9Y5Z0 518 aa22.65■■□□□ 1.22
TMOD3-203ENST00000558455 M0QZQ0 153 aa22.64■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 LILRA6Q6PI73 481 aa22.64■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 NCOR1O75376 2440 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 SPTLC1O15269 473 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 OR1D2P34982 312 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 LILRA4P59901 499 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 ZP2Q05996 745 aa22.63■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa22.63■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 DSTYKQ6XUX3 929 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 RDH13Q8NBN7 331 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 APPL2Q8NEU8 664 aa22.63■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 CDY1Q9Y6F8 540 aa22.63■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 C5orf42Q9H799 3197 aa22.63■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 C1orf127Q8N9H9 656 aa22.62■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.62■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa22.62■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 H7C4K7 107 aa22.61■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 PDXKO00764 312 aa22.61■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 TBC1D4O60343 1298 aa22.61■■□□□ 1.21
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TMOD3-203ENST00000558455 KIF20AO95235 890 aa22.61■■□□□ 1.21
TMOD3-203ENST00000558455 CYP24A1Q07973 514 aa22.61■■□□□ 1.21
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