RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CEP57	Q86XR8	500 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C12orf56	Q8IXR9	622 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C2CD2	Q9Y426	696 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SF3B1	O75533	1304 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	MYO10	Q9HD67	2058 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549		I3L4J1	428 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TRAPPC3	O43617	180 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	EXTL3	O43909	919 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	B3GAT3	O94766	335 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ADH1A	P07327	375 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ALAD	P13716	330 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	LRPAP1	P30533	357 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TNFSF9	P41273	254 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CREM	Q03060	361 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SURF1	Q15526	300 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	UPP1	Q16831	310 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	HPS3	Q969F9	1004 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C18orf25	Q96B23	403 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	FNIP2	Q9P278	1114 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	LACTBL1	A8MY62	500 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TISP43	B9A030	160 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TGFB1I1	O43294	461 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TGM5	O43548	720 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GPR37L1	O60883	481 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SMC2	O95347	1197 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GLUD1	P00367	558 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	HOXD13	P35453	343 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	MTHFR	P42898	656 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	BRCC3	P46736	316 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ACOT2	P49753	483 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SPAG1	Q07617	926 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	STK4	Q13043	487 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	MYBPC2	Q14324	1141 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	LILRA6	Q6PI73	481 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GPR149	Q86SP6	731 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA20	Q8TB22	786 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TRIO	O75962	3097 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CCDC195	A0A1B0GUA6	201 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF233	A6NK53	670 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PODXL	O00592	558 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PDXK	O00764	312 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	ADAM12	O43184	909 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	RFPL2	O75678	378 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PRR29	P0C7W0	189 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	COL9A1	P20849	921 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	FGFR3	P22607	806 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PSMD5	Q16401	504 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA1	Q5VX52	437 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	BEST2	Q8NFU1	509 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	TKT	P29401	623 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	NFIL3	Q16649	462 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RBM23-231	ENST00000557549	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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