RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 FAM189A1O60320 539 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 LAMP2P13473 410 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 LRPAP1P30533 357 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ACOT2P49753 483 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 IER5LQ5T953 404 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM130Q8N3G9 435 aa26.57■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.57■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 ZNF461Q8TAF7 563 aa26.57■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 RTL10Q7L3V2 364 aa26.56■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 CYP4F11Q9HBI6 524 aa26.56■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.56■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 TMEM132DQ14C87 1099 aa26.55■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB6Q15916 424 aa26.55■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 USP37Q86T82 979 aa26.55■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 A0A087X0B3 334 aa26.54■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 SYCP3Q8IZU3 236 aa26.54■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.54■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 FLCNQ8NFG4 579 aa26.54■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 PANK4Q9NVE7 773 aa26.54■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 CDH7Q9ULB5 785 aa26.54■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 ABLIM3O94929 683 aa26.53■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 ATF2P15336 505 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 PTPN5P54829 565 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 NHLH1Q02575 133 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 POSTNQ15063 836 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 SPATA1Q5VX52 437 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 SLC44A3Q8N4M1 653 aa26.53■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 PRSS33Q8NF86 280 aa26.53■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 YEATS4O95619 227 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ADRB2P07550 413 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 RFX1P22670 979 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 CCDC65Q8IXS2 484 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 ITFG1Q8TB96 612 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 FGF13Q92913 245 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 LRRC27Q9C0I9 530 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 IKZF4Q9H2S9 585 aa26.52■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 DERAQ9Y315 318 aa26.52■■□□□ 1.84
PRKCH-216ENST00000555542 STYXL1Q9Y6J8 313 aa26.52■■□□□ 1.84
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PRKCH-216ENST00000555542 ALCAMQ13740 583 aa26.51■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 SIX5Q8N196 739 aa26.51■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 ELMOD1Q8N336 334 aa26.51■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 MUC6Q6W4X9 2439 aa26.51■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 ARHGEF37A1IGU5 675 aa26.5■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 STK25O00506 426 aa26.5■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 CUTAO60888 179 aa26.5■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 F13A1P00488 732 aa26.5■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 RHOP08100 348 aa26.5■■□□□ 1.83
PRKCH-216ENST00000555542 SRFP11831 508 aa26.5■■□□□ 1.83
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