RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552958.5

AC004801.5-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AC004801.5, Length 550 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC004801.5-201ENST00000552958 PLS3P13797 630 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KCNE1P15382 129 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 GJA1P17302 382 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 GUCY2CP25092 1073 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MCM4P33991 863 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CCR2P41597 374 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KRT85P78386 507 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 STRN3Q13033 797 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KARSQ15046 597 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TMEM119Q4V9L6 283 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PDXDC1Q6P996 788 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ANKS3Q6ZW76 656 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 USP49Q70CQ1 688 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 APBB1IPQ7Z5R6 666 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KCNG4Q8TDN1 519 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 NXPE3Q969Y0 559 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CORO1BQ9BR76 489 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CYP4F11Q9HBI6 524 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CNTN3Q9P232 1028 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CCDC39Q9UFE4 941 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 FBXL5Q9UKA1 691 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SIT1Q9Y3P8 196 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 NUB1Q9Y5A7 615 aa10.13□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TISP43B9A030 160 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PPEF2O14830 753 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TRAPPC3O43617 180 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TBC1D4O60343 1298 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TOM1L1O75674 476 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ABLIM3O94929 683 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 HOXA9P31269 272 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TXLNAP40222 546 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 GRM2Q14416 872 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 UVSSAQ2YD98 709 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CTXN3Q4LDR2 81 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC44A4Q53GD3 710 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TANGO2Q6ICL3 276 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 GPIHBP1Q8IV16 184 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ADSSL1Q8N142 457 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ZNF461Q8TAF7 563 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SPIRE2Q8WWL2 714 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 DDX12PQ92771 950 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 BICD1Q96G01 975 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ZSWIM3Q96MP5 696 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PGLYRP2Q96PD5 576 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 REEP2Q9BRK0 252 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 IKZF4Q9H2S9 585 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ZHX3Q9H4I2 956 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SLC38A7Q9NVC3 462 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PCDHA7Q9UN72 937 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MYH11P35749 1972 aa10.12□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CACNA1HO95180 2353 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 LACTBL1A8MY62 500 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CLDN3O15551 220 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 VNN2O95498 520 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 LRG1P02750 347 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PTPN2P17706 415 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PLCG1P19174 1290 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ELF1P32519 619 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ME1P48163 572 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 STARD6P59095 220 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 ADCY1Q08828 1119 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MCM6Q14566 821 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 UBXN2BQ14CS0 331 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PRSS36Q5K4E3 855 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 RRAGBQ5VZM2 374 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 HAUS6Q7Z4H7 955 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 GPBP1Q86WP2 473 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 MYCT1Q8N699 235 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 PJA1Q8NG27 643 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 RASSF8Q8NHQ8 419 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 FAM212AQ96EL1 285 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KIF12Q96FN5 646 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CHAMP1Q96JM3 812 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SUSD3Q96L08 255 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SPATA32Q96LK8 384 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 TIPINQ9BVW5 301 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CRISPLD1Q9H336 500 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 C17orf75Q9HAS0 396 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 KCND2Q9NZV8 630 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 CEP72Q9P209 647 aa10.11□□□□□ -0.79
AC004801.5-201ENST00000552958 INSL5Q9Y5Q6 135 aa10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms