RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TNFSF13B	Q9Y275	285 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GDA	Q9Y2T3	454 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KIF3A	Q9Y496	699 aa		7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	WDR81	Q562E7	1941 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	WDR27	A2RRH5	827 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ARHGEF35	A5YM69	484 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688		K7ERI5	159 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CHRNB1	P11230	501 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CEBPB	P17676	345 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FCAR	P24071	287 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	RPA1	P27694	616 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GDI1	P31150	447 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HOXA6	P31267	233 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GRM5	P41594	1212 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	EPHA5	P54756	1037 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SPEM2	Q0P670	501 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MRPL58	Q14197	206 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	BECN1	Q14457	450 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZNF280D	Q6N043	979 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CD300LG	Q6UXG3	332 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LONP2	Q86WA8	852 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MFSD6L	Q8IWD5	586 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	APPL2	Q8NEU8	664 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MTMR6	Q9Y217	621 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NUB1	Q9Y5A7	615 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	INSL5	Q9Y5Q6	135 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	STK24	Q9Y6E0	443 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		7.5	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FANCM	Q8IYD8	2048 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CFAP54	Q96N23	3096 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MTCL1	Q9Y4B5	1905 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688		A0A087WWV3	80 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PODXL	O00592	558 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CHAD	O15335	359 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	STX6	O43752	255 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MED24	O75448	989 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	KCNE1	P15382	129 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LIG1	P18858	919 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CCNE1	P24864	410 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	BRCC3	P46736	316 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ARPP19	P56211	112 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	REST	Q13127	1097 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PTGDR	Q13258	359 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PLD1	Q13393	1074 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GRM2	Q14416	872 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	GLRA4	Q5JXX5	417 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	POTEH	Q6S545	545 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	VIT	Q6UXI7	678 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	YAF2	Q8IY57	180 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	BSND	Q8WZ55	320 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TCEAL4	Q96EI5	215 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	LOXL4	Q96JB6	756 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	SUSD3	Q96L08	255 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ACAP3	Q96P50	834 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	TMEM134	Q9H6X4	195 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	ASAH2	Q9NR71	780 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		7.49	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	MYBPHL	A2RUH7	354 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	PP2D1	A8MPX8	630 aa		7.48	□□□□□ -1.21
CS-233	ENST00000552688	HEPACAM2	A8MVW5	462 aa		7.48	□□□□□ -1.21

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