RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 UBXN2BQ14CS0 331 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 PSMD5Q16401 504 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 LIN9Q5TKA1 542 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 FAM171A1Q5VUB5 890 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 PDXDC1Q6P996 788 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 MPZL3Q6UWV2 235 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 RAD54LQ92698 747 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 PLIN2Q99541 437 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CXCL16Q9H2A7 254 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 NCDNQ9UBB6 729 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CACNG4Q9UBN1 327 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CLIC4Q9Y696 253 aa12.6□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 SHISA7A6NL88 538 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CCL16O15467 120 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 ADAM12O43184 909 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 STX6O43752 255 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 TBC1D4O60343 1298 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 ECI2O75521 394 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 KIF4AO95239 1232 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 PLCG1P19174 1290 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 ABCD1P33897 745 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 STRN3Q13033 797 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 SLC39A14Q15043 492 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 KARSQ15046 597 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 ZNF568Q3ZCX4 644 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 NPAS3Q8IXF0 933 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 UROC1Q96N76 676 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 REEP2Q9BRK0 252 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 SLC38A7Q9NVC3 462 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 STK17AQ9UEE5 414 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 GDAQ9Y2T3 454 aa12.59□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 F5P12259 2224 aa12.58□□□□□ -0.39
CS-221ENST00000550734 CASTOR2A6NHX0 329 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 NCAM2O15394 837 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 KRT37O76014 449 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PIGRP01833 764 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CD72P21854 359 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TARSP26639 723 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 NASPP49321 788 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 YARSP54577 528 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 LMNB2Q03252 620 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MCL1Q07820 350 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 UPP1Q16831 310 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 USP49Q70CQ1 688 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HAUS6Q7Z4H7 955 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GPBP1Q86WP2 473 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CEP57Q86XR8 500 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZNF687Q8N1G0 1237 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CEP120Q8N960 986 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SLC7A14Q8TBB6 771 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HASPINQ8TF76 798 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 EPSTI1Q96J88 318 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ACAP3Q96P50 834 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FIZ1Q96SL8 496 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 KXD1Q9BQD3 176 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TCHPQ9BT92 498 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PARVGQ9HBI0 331 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GDE1Q9NZC3 331 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CNTN3Q9P232 1028 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CHD6Q8TD26 2715 aa12.58□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CITO14578 2027 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TDGF1P13385 188 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FGFR3P22607 806 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 RPL9P32969 192 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 OR1D2P34982 312 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 GTF2BQ00403 316 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 MCM6Q14566 821 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 KYAT1Q16773 422 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 FAM173BQ6P4H8 233 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 POTEHQ6S545 545 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 CD300LGQ6UXG3 332 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZNF852Q6ZMS4 543 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TPRG1Q6ZUI0 275 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 USP28Q96RU2 1077 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-221ENST00000550734 TSPAN18Q96SJ8 248 aa12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms