RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546480.1

VENTXP3-201, Transcript of VENT homeobox pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene VENTXP3, Length 773 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VENTXP3-201ENST00000546480 C2CD2Q9Y426 696 aa14.92□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 DLL1O00548 723 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 EXOC3O60645 756 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 LILRB3O75022 631 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SMC2O95347 1197 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 EFEMP2O95967 443 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 KRT19P08727 400 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 LRPAP1P30533 357 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CBWD2Q8IUF1 395 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 EFCAB13Q8IY85 973 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 XXYLT1Q8NBI6 393 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 PIK3R5Q8WYR1 880 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SMARCE1Q969G3 411 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 FNBP1Q96RU3 617 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 RXFP1Q9HBX9 757 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 PDE11AQ9HCR9 933 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 RMND1Q9NWS8 449 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 FNIP2Q9P278 1114 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 DPP7Q9UHL4 492 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CDY1Q9Y6F8 540 aa14.91□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 VWA8A3KMH1 1905 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 PPEF2O14830 753 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 RHOBTB3O94955 611 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ITGB3P05106 788 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ADRB2P07550 413 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 WEE2P0C1S8 567 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 FGFR3P22607 806 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 WNT7BP56706 349 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 KCNC3Q14003 757 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ZBTB6Q15916 424 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CD300LGQ6UXG3 332 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ANKS3Q6ZW76 656 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 USP37Q86T82 979 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SMRP1Q8NCR6 262 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 APPL2Q8NEU8 664 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 ENGASEQ8NFI3 743 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 SFXN1Q9H9B4 322 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 MYO7AQ13402 2215 aa14.9□□□□□ -0.02
VENTXP3-201ENST00000546480 H7C4K7 107 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SYN3O14994 580 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 TGM5O43548 720 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 TNNC2P02585 160 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 ODC1P11926 461 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 TNNI1P19237 187 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SP100P23497 879 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 OR1D2P34982 312 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 TAF6P49848 677 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 KCNB1Q14721 858 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SURF1Q15526 300 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 CTXN3Q4LDR2 81 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 LIN9Q5TKA1 542 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 ISM2Q6H9L7 571 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF280DQ6N043 979 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SYCE2Q6PIF2 218 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 NT5DC4Q86YG4 428 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 FAM84AQ96KN4 292 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SUSD3Q96L08 255 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 ZNF560Q96MR9 790 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 TIGD1Q96MW7 591 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 MTMR12Q9C0I1 747 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.89□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 CPB1P15086 417 aa14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 UBE2HP62256 183 aa14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 ITIH3Q06033 890 aa14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 SV2CQ496J9 727 aa14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 CEP135Q66GS9 1140 aa14.88□□□□□ -0.03
VENTXP3-201ENST00000546480 GPR65Q8IYL9 337 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms