RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX28O15482 410 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FGF19O95750 216 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 LRG1P02750 347 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 POU2F2P09086 479 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SLFN14P0C7P3 912 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ODC1P11926 461 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 TAF12Q16514 161 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EEF1DP3Q658K8 133 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 GPR149Q86SP6 731 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SFR1Q86XK3 245 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 DHX58Q96C10 678 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 PANK2Q9BZ23 570 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 S1PR5Q9H228 398 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 POLD4Q9HCU8 107 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 MAN1C1Q9NR34 630 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 EXOC1Q9NV70 894 aa6.08□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 TBC1D7Q9P0N9 293 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 ARID2Q68CP9 1835 aa6.08□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 TGM5O43548 720 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM191BP0C7N4 346 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 AP3M2P53677 418 aa6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
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CLSTN3-215ENST00000544584 HASPINQ8TF76 798 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC22A17Q8WUG5 538 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 AUTS2Q8WXX7 1259 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 SUSD3Q96L08 255 aa6.07□□□□□ -1.44
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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