RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	C2orf78	A6NCI8	922 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GOLIM4	O00461	696 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TOX4	O94842	621 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ARIH2	O95376	493 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GYPE	P15421	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	KIR2DL3	P43628	341 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	WNT3A	P56704	352 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	BPIFB4	P59827	614 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	FGL2	Q14314	439 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	MST1L	Q2TV78	715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	AGBL4	Q5VU57	503 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	USP30	Q70CQ3	517 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CLEC14A	Q86T13	490 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CERS3	Q8IU89	383 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	OR7D4	Q8NG98	312 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	STON2	Q8WXE9	905 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	APOL5	Q9BWW9	433 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	EPC1	Q9H2F5	836 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	BCO1	Q9HAY6	547 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	STAP2	Q9UGK3	403 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	NAIP	Q13075	1403 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	COL14A1	Q05707	1796 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ITSN1	Q15811	1721 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MDM2-223	ENST00000536089	ITGA10	O75578	1167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	HRG	P04196	525 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KRT1	P04264	644 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	INHBB	P09529	407 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PEX2	P28328	305 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SREBF1	P36956	1147 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GPSM2	P81274	684 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NOG	Q13253	232 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RAB39A	Q14964	217 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ATP2B3	Q16720	1220 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LONRF1	Q17RB8	773 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089		Q6ZVL8	140 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ZDHHC14	Q8IZN3	488 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ADGRG2	Q8IZP9	1017 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CARF	Q8N187	725 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SLC35A4	Q96G79	324 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LCOR	Q96JN0	433 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	MYD88	Q99836	296 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	LRFN3	Q9BTN0	628 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	KATNBL1	Q9H079	304 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PNPO	Q9NVS9	261 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ABCF2	Q9UG63	623 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	L1RE1	Q9UN81	338 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	DISP2	A7MBM2	1401 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NRAP	Q86VF7	1730 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	SBNO1	A3KN83	1393 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	ANKAR	Q7Z5J8	1434 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1B0GTL3	188 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PPL8	197 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NRP1	O14786	923 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	NUAK1	O60285	661 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MDM2-223	ENST00000536089	GPR32	O75388	356 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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