RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534143.5

CMTM1-220, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-220ENST00000534143 PSMA7O14818 248 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SLC16A4O15374 487 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 TGFB1I1O43294 461 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DYRK3O43781 588 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ICMTO60725 284 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 TNFRSF21O75509 655 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KIF20AO95235 890 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 NOS3P29474 1203 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 CLCN3P51790 818 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 STX17P56962 302 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 MYL5Q02045 173 aa6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 KCNA1Q09470 495 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 STIM1Q13586 685 aa6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KSR1Q8IVT5 923 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 SLC43A3Q8NBI5 491 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 RETREG2Q8NC44 543 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 HVCN1Q96D96 273 aa6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 DEFB118Q96PH6 123 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ADAM19Q9H013 955 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 RNF208Q9H0X6 261 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 KMT5AQ9NQR1 393 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa6.72□□□□□ -1.33
CMTM1-220ENST00000534143 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
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CMTM1-220ENST00000534143 C17orf102A2RUQ5 167 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 DENND3A2RUS2 1198 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TRIM49BA6NDI0 452 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 BECN2A8MW95 431 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 H0YCG3 227 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 SCP2P22307 547 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 NFIL3Q16649 462 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 RUFY4Q6ZNE9 571 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 NELFCDQ8IXH7 590 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 C7orf31Q8N865 590 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 ACCSQ96QU6 501 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 PPP1R9BQ96SB3 815 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 KIFC3Q9BVG8 833 aa6.71□□□□□ -1.34
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CMTM1-220ENST00000534143 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 IKZF4Q9H2S9 585 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TMEM206Q9H813 350 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 DZANK1Q9NVP4 752 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 FANCLQ9NW38 375 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 DMAC2Q9NW81 257 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 TBX20Q9UMR3 447 aa6.71□□□□□ -1.34
CMTM1-220ENST00000534143 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.71□□□□□ -1.34
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