RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 FOXS1O43638 330 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BCAR3O75815 825 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SRGNP10124 158 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MCCP23508 829 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 HALP42357 657 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS15P98073 1019 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DCTN1Q14203 1278 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 FUKQ8N0W3 1084 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 IL17REQ8NFR9 667 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 Q8TCH9 128 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CFHR4Q92496 578 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 LPPQ93052 612 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 FERMT2Q96AC1 680 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 PRDM11Q9NQV5 511 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF69Q9UC07 566 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DNAI1Q9UI46 699 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 FAM50BQ9Y247 325 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 SHANK3Q9BYB0 1731 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CACNA1FO60840 1977 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 NBNO60934 754 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 COPB2P35606 906 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SELENOPP49908 381 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 KRTAP10-2P60368 255 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.93□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 WDR17Q8IZU2 1322 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TOM1O60784 492 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 RAD17O75943 681 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 RPS19P39019 145 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DHCR24Q15392 516 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TERF2Q15554 542 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DDB1Q16531 1140 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PTPN21Q16825 1174 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PALM2Q8IXS6 379 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 TSPYL6Q8N831 410 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 MSL2Q9HCI7 577 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PLCB1Q9NQ66 1216 aa4.92□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 LCHNA4D1U4 455 aa4.91□□□□□ -1.62
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PTPRC-214ENST00000530727 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 BRINP1O60477 761 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 OPHN1O60890 802 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PCDH8O95206 1070 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 COMTP21964 271 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 AMOTQ4VCS5 1084 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 DBX2Q6ZNG2 339 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 C8orf58Q8NAV2 365 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SHCBP1Q8NEM2 672 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 PARD3BQ8TEW8 1205 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRC-214ENST00000530727 SSH1Q8WYL5 1049 aa4.91□□□□□ -1.62
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