RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525107.6

LMO7-215, Transcript of LIM domain 7, human

TSL 5

Gene LMO7, Length 536 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO7-215	ENST00000525107	KRT85	P78386	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	IL10RA	Q13651	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	UAP1L1	Q3KQV9	507 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	DACT2	Q5SW24	774 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PAPD7	Q5XG87	772 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PPP4R3A	Q6IN85	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	GPR149	Q86SP6	731 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NACC2	Q96BF6	587 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	IPP	Q9Y573	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	GRM6	O15303	877 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SGTA	O43765	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	HAUS5	O94927	633 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ZFPL1	O95159	310 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	RPLP2	P05387	115 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SLC6A4	P31645	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CLK3	P49761	638 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SEC24C	P53992	1094 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	C21orf58	P58505	322 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NOMO3	P69849	1222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	BLOC1S1	P78537	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	IFI44	Q8TCB0	444 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	KAT5	Q92993	513 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	COA7	Q96BR5	231 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PNKP	Q96T60	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NIPSNAP3A	Q9UFN0	247 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	TNKS	O95271	1327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	RAB39A	Q14964	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ODF1	Q14990	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PTPRO	Q16827	1216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	COLEC12	Q5KU26	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107		Q8NA96	180 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ASPSCR1	Q9BZE9	553 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		4.88	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	AGFG2	O95081	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	NUDT3	O95989	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CD1A	P06126	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	FDXR	P22570	491 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MPL	P40238	635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ADK	P55263	362 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MIER2	Q8N344	545 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MED15	Q96RN5	788 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CASS4	Q9NQ75	786 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	ANKRD62	A6NC57	917 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	SBK3	P0C264	359 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	FCER1A	P12319	257 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MPP3	Q13368	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CYP2A13	Q16696	494 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107		Q96MF0	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		4.86	□□□□□ -1.63
LMO7-215	ENST00000525107	CALCOCO1	Q9P1Z2	691 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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