RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522926.1

TNIP1-216, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TNIP1, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-216ENST00000522926 CDT1Q9H211 546 aa20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SEMA4GQ9NTN9 838 aa20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 RAB23Q9ULC3 237 aa20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ASPMQ8IZT6 3477 aa20.11■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 MICAL2O94851 1124 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 RETP07949 1114 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 PSMC3P17980 439 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 FNTBP49356 437 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 CCR3P51677 355 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 NETO1Q8TDF5 533 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TRPV5Q9NQA5 729 aa20.1■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF197O14709 1029 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 MYL4P12829 197 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 RPA1P27694 616 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 GRM5P41594 1212 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SOX9P48436 509 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TWF1Q12792 350 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TEAD2Q15562 447 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ME3Q16798 604 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 Q6ZS52 159 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TAS1R3Q7RTX0 852 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 GPIHBP1Q8IV16 184 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TNFSF13BQ9Y275 285 aa20.09■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 K7ESF4 209 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 VNN2O95498 520 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 CXCL12P48061 93 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 EFNA5P52803 228 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 PPP2R5AQ15172 486 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 CYP4A22Q5TCH4 519 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SHKBP1Q8TBC3 707 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 TRPV4Q9HBA0 871 aa20.08■□□□□ 0.81
TNIP1-216ENST00000522926 SPEGQ15772 3267 aa20.08■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 HEPACAM2A8MVW5 462 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ABLIM1O14639 778 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SYN3O14994 580 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 EPHA5P54756 1037 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 PTGDRQ13258 359 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 CTXN3Q4LDR2 81 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TPGS2Q68CL5 300 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 RNF19BQ6ZMZ0 732 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 MFSD6LQ8IWD5 586 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 GTF3C6Q969F1 213 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 IFT74Q96LB3 600 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 LRRC3BQ96PB8 259 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 IER2Q9BTL4 223 aa20.07■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SLC38A8A6NNN8 435 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 K7ERI5 159 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF263O14978 683 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 LRP3O75074 770 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 KCNE1P15382 129 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 PPP2R5DQ14738 602 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 CSRP2Q16527 193 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF568Q3ZCX4 644 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 DAW1Q8N136 415 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SUSD3Q96L08 255 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 LRRC3Q9BY71 257 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 CRISPLD1Q9H336 500 aa20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 H7C4K7 107 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 NPTX2P47972 431 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 YARSP54577 528 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 GUCY1B3Q02153 619 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ST3GAL1Q11201 340 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF174Q15697 407 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 IQCEQ6IPM2 695 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TMC8Q8IU68 726 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TTC8Q8TAM2 541 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 DDX12PQ92771 950 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ASAH2Q9NR71 780 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SLC38A7Q9NVC3 462 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 CNTN3Q9P232 1028 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 NUB1Q9Y5A7 615 aa20.05■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 OR4Q2P0C623 313 aa20.04■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 OR52Z1P0C646 297 aa20.04■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 PROZP22891 400 aa20.04■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 PEX3P56589 373 aa20.04■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 SEZ6Q53EL9 994 aa20.04■□□□□ 0.8
TNIP1-216ENST00000522926 ZNF280DQ6N043 979 aa20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms