RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	USP45	Q70EL2	814 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	GAREM2	Q75VX8	874 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	GSPT2	Q8IYD1	628 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	OR2C3	Q8N628	320 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	GAB3	Q8WWW8	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	LRTOMT	Q8WZ04	291 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RRN3	Q9NYV6	651 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		4.76	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CAPN8	A6NHC0	703 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCER2	I3L3R5	266 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	EXOC5	O00471	708 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PDC	P20941	246 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HTR1B	P28222	390 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PPM1A	P35813	382 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK17	Q00537	523 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	KCTD2	Q14681	263 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	ADRM1	Q16186	407 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DGKD	Q16760	1214 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NPNT	Q6UXI9	565 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA1191	Q96A73	305 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	USP18	Q9UMW8	372 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	SNX13	Q9Y5W8	968 aa		4.75	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	TLR5	O60602	858 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RHOBTB3	O94955	611 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFAIP3	P21580	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFSF4	P23510	183 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	LMO1	P25800	156 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	WAS	P42768	502 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MAPK10	P53779	464 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HGFAC	Q04756	655 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	FSTL1	Q12841	308 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MAP3K12	Q12852	859 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MALL	Q13021	153 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DAAM2	Q86T65	1068 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	COA7	Q96BR5	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK5RAP3	Q96JB5	506 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HIST1H2AH	Q96KK5	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HIST1H2AJ	Q99878	128 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	AGO3	Q9H9G7	860 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	POLR3B	Q9NW08	1133 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		4.74	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PRX2	142 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH2	P05091	517 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	EDNRB	P24530	442 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DDIT3	P35638	169 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PPP3CA	Q08209	521 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RIN1	Q13671	783 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	BLMH	Q13867	455 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	ANO6	Q4KMQ2	910 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PCSK4	Q6UW60	755 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	FATE1	Q969F0	183 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	DYDC2	Q96IM9	177 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CGRRF1	Q99675	332 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	OSBPL6	Q9BZF3	934 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	MAGEL2	Q9UJ55	1249 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.73	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PR48	441 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC154	A6NI56	674 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	PRSS47	A8MTI9	375 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702		M0R3H8	397 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NCK2	O43639	380 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	NRP2	O60462	931 aa		4.72	□□□□□ -1.65
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM127	O75204	238 aa		4.72	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms