RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 OSTNP61366 133 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 PPP2R3AQ06190 1150 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 VPS52Q8N1B4 723 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 APOL5Q9BWW9 433 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ASB7Q9H672 318 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CTNND2Q9UQB3 1225 aa21.85■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 MEIS3P2A8K0S8 358 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 MAPK13O15264 365 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 OFD1O75665 1012 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 RECQL4O94761 1208 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CXCL14O95715 111 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 AKAP5P24588 427 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 TYRO3Q06418 890 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CES5AQ6NT32 575 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 AGMOQ6ZNB7 445 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 EFCAB3Q8N7B9 438 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 IGSF21Q96ID5 467 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 MFSD14AQ96MC6 490 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CEP63Q96MT8 703 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 MKNK1Q9BUB5 465 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 S1PR5Q9H228 398 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 SLC38A7Q9NVC3 462 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 DMAC2Q9NW81 257 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 HES2Q9Y543 173 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa21.84■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 TISP43B9A030 160 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 GNA14O95837 355 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 EPB41P11171 864 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ACOT2P49753 483 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 DPCR1Q3MIW9 517 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 CEP135Q66GS9 1140 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ANKRD40Q6AI12 368 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 SYCE2Q6PIF2 218 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 HFE2Q6ZVN8 426 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 FBXL18Q96ME1 805 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 ZBP1Q9H171 429 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 STK39Q9UEW8 545 aa21.83■■□□□ 1.09
USP53-208ENST00000514305 TRIOO75962 3097 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SYCE3A1L190 88 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 INPPL1O15357 1258 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 THP07101 528 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 GALTP07902 379 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 KRT13P13646 458 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 ITIH3Q06033 890 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CEP120Q8N960 986 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SAAL1Q96ER3 474 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 FNBP1Q96RU3 617 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 KCNH6Q9H252 994 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 DNAJB4Q9UDY4 337 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 DERAQ9Y315 318 aa21.82■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 ARL5CA6NH57 179 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CTSAP10619 480 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 MLH1P40692 756 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SLC11A1P49279 550 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 ENPEPQ07075 957 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 GRIK3Q13003 919 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 TRIM67Q6ZTA4 783 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 FAM114A1Q8IWE2 563 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 BRSK2Q8IWQ3 736 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 RDH13Q8NBN7 331 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SNX27Q96L92 541 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 NECTIN4Q96NY8 510 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 GAD1Q99259 594 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 IKZF4Q9H2S9 585 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 DZANK1Q9NVP4 752 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 NR2E1Q9Y466 385 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 IRAK3Q9Y616 596 aa21.81■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 TECTAO75443 2155 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 SMTNL1A8MU46 457 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 CXCL8P10145 99 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 KCNE1P15382 129 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 STX17P56962 302 aa21.8■■□□□ 1.08
USP53-208ENST00000514305 ZXDAP98168 799 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms