RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508350.1

CDH18-208, Transcript of cadherin 18, human

TSL 4

Gene CDH18, Length 578 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CDH18-208	ENST00000508350	NR3C1	P04150	777 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	MYL1	P05976	194 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	TH	P07101	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	LAG3	P18627	525 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	GART	P22102	1010 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	BRCC3	P46736	316 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	CDR1	P51861	262 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	STX17	P56962	302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	GRIK3	Q13003	919 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PSMD2	Q13200	908 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	ALCAM	Q13740	583 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	MORC3	Q14149	939 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	MSS51	Q4VC12	460 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	XKR4	Q5GH76	650 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	CEP135	Q66GS9	1140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	ANKRD40	Q6AI12	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	STXBP4	Q6ZWJ1	553 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	ELOA2	Q8IYF1	753 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	HACE1	Q8IYU2	909 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	FEZF2	Q8TBJ5	459 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	GSDMA	Q96QA5	445 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	MED15	Q96RN5	788 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM206	Q9H813	350 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	UBN1	Q9NPG3	1134 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	DMAC2	Q9NW81	257 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	CNTN3	Q9P232	1028 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	UBE4B	O95155	1302 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	VWA8	A3KMH1	1905 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CDH18-208	ENST00000508350	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZNF233	A6NK53	670 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HIDE1	A8MVS5	230 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	C5orf67	F2Z3F1	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350		H3BNC9	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PODXL	O00592	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PDXK	O00764	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	C2CD2L	O14523	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PER2	O15055	1255 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	EXOC3	O60645	756 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	AKAP3	O75969	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	B3GAT3	O94766	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ALDH2	P05091	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RB1	P06400	928 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	KCNE1	P15382	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FOSL2	P15408	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SCP2	P22307	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CLCNKB	P51801	687 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DLG4	P78352	724 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	PPP2R3A	Q06190	1150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CYP24A1	Q07973	514 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TUSC3	Q13454	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HSP90AA2P	Q14568	343 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	TTI2	Q6NXR4	508 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	CYP4X1	Q8N118	509 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	ADSSL1	Q8N142	457 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	VPS52	Q8N1B4	723 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDH18-208	ENST00000508350	GPD1L	Q8N335	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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