RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 IQCF3P0C7M6 154 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF286BP0CG31 522 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SMPD1P17405 629 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EPHB4P54760 987 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CAP1Q01518 475 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CENPCQ03188 943 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GPS2Q13227 327 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ACVR2BQ13705 512 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EEF1DP3Q658K8 133 aa8.77□□□□□ -1.01
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PDE4D-208ENST00000502484 IFT20Q8IY31 132 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MTMR12Q9C0I1 747 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CDT1Q9H211 546 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 BRCA2P51587 3418 aa8.77□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RAD51CO43502 376 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CALCAP01258 141 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MMP3P08254 477 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMOD1P28289 359 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 OAS2P29728 719 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF132P52740 706 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IRF5Q13568 498 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CLUL1Q15846 466 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AMHR2Q16671 573 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SCARA3Q6AZY7 606 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EMBQ6PCB8 327 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MTHFD1LQ6UB35 978 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 THNSL1Q8IYQ7 743 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MCOLN2Q8IZK6 566 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 UBL4BQ8N7F7 174 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CD101Q93033 1021 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM11Q96F44 468 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HINFPQ9BQA5 517 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ZSWIM1Q9BR11 485 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 WNT8AQ9H1J5 351 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 A0A087WZ62 844 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KRIT1O00522 736 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 IL18RAPO95256 599 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GNRH1P01148 92 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FGGP02679 453 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MYBL1P10243 752 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 COMTP21964 271 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 HOXD10P28358 340 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GNA15P30679 374 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MESDQ14696 234 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM132AQ24JP5 1023 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL7Q8IXQ5 586 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EFCAB13Q8IY85 973 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CEP120Q8N960 986 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ALG3Q92685 438 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FAM212AQ96EL1 285 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AP1M1Q9BXS5 423 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AKT3Q9Y243 479 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRIM17Q9Y577 477 aa8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 H3BQF6 201 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM191BP0C7N4 346 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MCF2P10911 925 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NSFP46459 744 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PEX5P50542 639 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MYL6P60660 151 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 NOMO3P69849 1222 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 GUCY2DQ02846 1103 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 TNFAIP2Q03169 654 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 DGKDQ16760 1214 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 MON1BQ7L1V2 547 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 OR6J1Q8NGC5 347 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 SOCS4Q8WXH5 440 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 KRT35Q92764 455 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CAVIN3Q969G5 261 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.75□□□□□ -1.01
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.75□□□□□ -1.01
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