RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL5C	A6NH57	179 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM170B	A6NMN3	283 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TADA2A	O75478	443 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMD10	O75832	226 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ARHGAP8	P85298	464 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKP	Q01813	784 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKCQ	Q04759	706 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	UBXN11	Q5T124	520 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FUT10	Q6P4F1	479 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PARM1	Q6UWI2	310 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ANO5	Q75V66	913 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MTSS1L	Q765P7	747 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF149	Q8NC42	400 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF31	Q8WWY3	499 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FGF14	Q92915	247 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ACD	Q96AP0	544 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CDH7	Q9ULB5	785 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	IPP	Q9Y573	584 aa		12.05	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W810	466 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NCAM2	O15394	837 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	EFS	O43281	561 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MARCH6	O60337	910 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	STBD1	O95210	358 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TDP2	O95551	362 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEA9	P43362	315 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	QARS	P47897	775 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ATXN1	P54253	815 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NPEPPS	P55786	919 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CTBS	Q01459	385 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LAMTOR4	Q0VGL1	99 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511		Q4G0T1	1027 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC44A4	Q53GD3	710 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1L	Q5SGD2	360 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NOTUM	Q6P988	496 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP57	Q86XR8	500 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MAML2	Q8IZL2	1156 aa	Predicted RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	TCP11	Q8WWU5	503 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	BRF1	Q92994	677 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP89	Q96ST8	783 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RPP25	Q9BUL9	199 aa	Known RBP	12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	MARK1	Q9P0L2	795 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	FNIP2	Q9P278	1114 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB23	Q9ULC3	237 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HES2	Q9Y543	173 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		12.04	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	C2orf16	Q68DN1	1984 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	INO80B-WBP1	J3KQ70	363 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ASAP2	O43150	1006 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	XYLB	O75191	536 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	C1R	P00736	705 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CD72	P21854	359 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	AXL	P30530	894 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	NTHL1	P78549	312 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DSC1	Q08554	894 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ST3GAL2	Q16842	350 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511		Q6ZUG5	572 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	STK32A	Q8WU08	396 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC51	Q96ER9	411 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CPB2	Q96IY4	423 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	SUSD3	Q96L08	255 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RTKN	Q9BST9	563 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF2A	Q9BY44	585 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CHST7	Q9NS84	486 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX25	Q9UHL0	483 aa	Known RBP	12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM28	Q9UKQ2	775 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	GIT1	Q9Y2X7	761 aa		12.03	□□□□□ -0.48
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL16	O15467	120 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	C8A	P07357	584 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	HNRNPA1	P09651	372 aa	Known RBP eCLIP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	ARAF	P10398	606 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	CPA1	P15085	419 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TFDP1	Q14186	410 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	EMC2	Q15006	297 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	LILRA6	Q6PI73	481 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TSSK4	Q6SA08	328 aa		12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	12.02	□□□□□ -0.49
SKAP2-209	ENST00000497511	TPRG1	Q6ZUI0	275 aa		12.02	□□□□□ -0.49

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