RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496565.5

LPIN3-204, Transcript of lipin 3, human

TSL 3

Gene LPIN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LPIN3-204	ENST00000496565	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GNG11	P61952	73 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGAP44	Q17R89	818 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF699	Q32M78	642 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UNC93A	Q86WB7	457 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UBR7	Q8N806	425 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	APBB2	Q92870	758 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CPB2	Q96IY4	423 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MIS12	Q9H081	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ERVK-5	Q9HDB9	667 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DPP3	Q9NY33	737 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RNF14	Q9UBS8	474 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ST3GAL5	Q9UNP4	418 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	REXO2	Q9Y3B8	237 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NOC2L	Q9Y3T9	749 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		10.07	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565		A0A0U1RQF3	1178 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	USP27X	A6NNY8	438 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF4A	O95239	1232 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CHRNA1	P02708	482 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LRPAP1	P30533	357 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	THPO	P40225	353 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF132	P52740	706 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SNX16	P57768	344 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CHMP4BP1	P59074	171 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PAK2	Q13177	524 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DSC3	Q14574	896 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CLUL1	Q15846	466 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UBXN11	Q5T124	520 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TATDN2	Q93075	761 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	KIF12	Q96FN5	646 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ABHD8	Q96I13	439 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DESI2	Q9BSY9	194 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CDHR5	Q9HBB8	845 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GINS2	Q9Y248	185 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP83	Q9Y592	693 aa		10.06	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CES2	O00748	559 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZNF263	O14978	683 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	RECQL4	O94761	1208 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MTA2	O94776	668 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ITGA4	P13612	1032 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SELP	P16109	830 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MYL6	P60660	151 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GPC5	P78333	572 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	FAM189B	P81408	668 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ARID5A	Q03989	594 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	INCA1	Q0VD86	236 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	GJB7	Q6PEY0	223 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	CEP120	Q8N960	986 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ARMC5	Q96C12	935 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	ZBTB10	Q96DT7	871 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	HPDL	Q96IR7	371 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UROC1	Q96N76	676 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LHX5	Q9H2C1	402 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	SNTG2	Q9NY99	539 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	UVRAG	Q9P2Y5	699 aa		10.05	□□□□□ -0.8
LPIN3-204	ENST00000496565	DNAI1	Q9UI46	699 aa		10.05	□□□□□ -0.8

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