RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495893.6

PHC3-215, Transcript of polyhomeotic homolog 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PHC3, Length 12,666 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC3-215ENST00000495893 NARFQ9UHQ1 456 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ENOPH1Q9UHY7 261 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SPDYE5A6NIY4 337 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 IST1P53990 364 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 FKBP1BP68106 108 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 C1orf228Q6PIY5 440 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KDM7AQ6ZMT4 941 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CABP7Q86V35 215 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SCUBE1Q8IWY4 988 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MCUQ8NE86 351 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 COMMD9Q9P000 198 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MAPRE3Q9UPY8 281 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MYH8P13535 1937 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PIPSLA2A3N6 862 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SPDYE2BA6NHP3 402 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TRIM64CA6NLI5 447 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PPP6R2O75170 966 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SPDYE6P0CI01 402 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CHN1P15882 459 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ITGA9Q13797 1035 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 FAM180AQ6UWF9 173 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 DNAAF3Q8N9W5 541 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MCUBQ9NWR8 336 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RRN3Q9NYV6 651 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RTEL1Q9NZ71 1219 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 LRWD1Q9UFC0 647 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ATF6P18850 670 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PAX3P23760 479 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 GPTP24298 496 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RCVRNP35243 200 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KCNB1Q14721 858 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 C5orf22Q49AR2 442 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KCTD21Q4G0X4 260 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 AKNAD1Q5T1N1 836 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PMF1Q6P1K2 205 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ARHGEF19Q8IW93 802 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PLBD2Q8NHP8 589 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 FAF2Q96CS3 445 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ERP27Q96DN0 273 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PLIN2Q99541 437 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CDYLQ9Y232 598 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MYRFQ9Y2G1 1151 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SOWAHDA6NJG2 315 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 UFL1O94874 794 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ZCCHC18P0CG32 403 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 S100A2P29034 98 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CXCR5P32302 372 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PTK2Q05397 1052 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 OCLNQ16625 522 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 BICRALQ6AI39 1079 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PLEKHA8Q96JA3 519 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PRRG3Q9BZD7 231 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CEP72Q9P209 647 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TELO2Q9Y4R8 837 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ECDO95905 644 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KITP10721 976 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ALOX12P18054 663 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MYL7Q01449 175 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KDSRQ06136 332 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 NR1D2Q14995 579 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 ZFP69Q49AA0 526 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KLHL24Q6TFL4 600 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SCAIQ8N9R8 606 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 COX4I2Q96KJ9 171 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 DENND2AQ9ULE3 1009 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SNAP23O00161 211 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TEX28O15482 410 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 MFAP3LO75121 409 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 SRP72O76094 671 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 COPAP53621 1224 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 LRRC63Q05C16 580 aa3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PHC3-215ENST00000495893 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms