RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495571.5

VWA3B-220, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3B, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3B, Length 2,711 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3B-220ENST00000495571 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NDE1Q9NXR1 346 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NOX1Q9Y5S8 564 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 A0A1W2PRG0 241 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 A8MU76 341 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 MAGEB2O15479 319 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 HAUS5O94927 633 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 STAMBPO95630 424 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TTC4O95801 387 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 FUCA1P04066 466 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DLATP10515 647 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ALAS1P13196 640 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PON1P27169 355 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DRG2P55039 364 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 MECOMQ03112 1051 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 GRB10Q13322 594 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 MED21Q13503 144 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SPARCL1Q14515 664 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 UBE3CQ15386 1083 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 CNNM4Q6P4Q7 775 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 BLIDQ8IZY5 108 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 GRAMD1AQ96CP6 724 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NSL1Q96IY1 281 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 HERPUD2Q9BSE4 406 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHA6Q9UN73 950 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TELO2Q9Y4R8 837 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 BCORQ6W2J9 1755 aa9.06□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DYTNA2CJ06 578 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DCAF8L1A6NGE4 600 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 B2RBV5 119 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 E5RJQ4 531 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 E9PBE3 544 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 GOLGA8RI6L899 631 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 THAP12O43422 761 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ENO1P06733 434 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 RARBP10826 455 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NELFEP18615 380 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ADRA1DP25100 572 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 EPS15P42566 896 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SERPINB8P50452 374 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 VCPP55072 806 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PDE1BQ01064 536 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PLCB3Q01970 1234 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 KDSRQ06136 332 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 LPIN1Q14693 890 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 C16orf72Q14CZ0 275 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ARSHQ5FYA8 562 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 C16orf87Q6PH81 154 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM59Q8IWR1 403 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ARHGAP24Q8N264 748 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 BBS5Q8N3I7 341 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 PNMA5Q96PV4 448 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 CSRNP1Q96S65 589 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NEURL2Q9BR09 285 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NMUR2Q9GZQ4 415 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 EURLQ9NYK6 297 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 LZTS1Q9Y250 596 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TRIM17Q9Y577 477 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SPEF2Q9C093 1822 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 CAPN8A6NHC0 703 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 C2CD2LO14523 706 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 TTLL1O95922 423 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 UQCRBP14927 111 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 SMARCA1P28370 1054 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 COILP38432 576 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NOP14P78316 857 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 MTM1Q13496 603 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 CAMK2BQ13554 666 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 LETM2Q2VYF4 491 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 MMEL1Q495T6 779 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 DCAF6Q58WW2 860 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 OGFOD2Q6N063 350 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 NLRP10Q86W26 655 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 CCDC65Q8IXS2 484 aa9.05□□□□□ -0.96
VWA3B-220ENST00000495571 ACTRT2Q8TDY3 377 aa9.05□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms