RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493708.5

ASL-209, Transcript of argininosuccinate lyase, human

TSL 3

Gene ASL, Length 885 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ASL-209	ENST00000493708	PPP1R37	O75864	691 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ABLIM3	O94929	683 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	LAMP2	P13473	410 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	AVPR2	P30518	371 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	GUCY2F	P51841	1108 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ARPP19	P56211	112 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ADAL	Q6DHV7	355 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	CD302	Q8IX05	232 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	HVCN1	Q96D96	273 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	STRA6	Q9BX79	667 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	IKZF4	Q9H2S9	585 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	FBXL5	Q9UKA1	691 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	PPP6R2	O75170	966 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ACOT2	P49753	483 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	CTXN3	Q4LDR2	81 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ZNF280D	Q6N043	979 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	PDILT	Q8N807	584 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	NXPE3	Q969Y0	559 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	TBC1D7	Q9P0N9	293 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708		M0QZQ0	153 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	IDE	P14735	1019 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ELF1	P32519	619 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	SPATA1	Q5VX52	437 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	JADE1	Q6IE81	842 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ASL-209	ENST00000493708	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ATF2	P15336	505 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	KCNA1	Q09470	495 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PRSS33	Q8NF86	280 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	BEST2	Q8NFU1	509 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	HCFC1R1	Q9NWW0	138 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	DNMT3B	Q9UBC3	853 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	CDH7	Q9ULB5	785 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	YEATS4	O95619	227 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ADSS	P30520	456 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	NHLH1	Q02575	133 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	POSTN	Q15063	836 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	TCEAL8	Q8IYN2	117 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ITFG1	Q8TB96	612 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ACCS	Q96QU6	501 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PRRX2	Q99811	253 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	CYP4F11	Q9HBI6	524 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	TIMM13	Q9Y5L4	95 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ARHGEF37	A1IGU5	675 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ANHX	E9PGG2	379 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PRRG1	O14668	218 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PPEF2	O14830	753 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	GCNT3	O95395	438 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	NFIC	P08651	508 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	HTR4	Q13639	388 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	TPGS2	Q68CL5	300 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ASB7	Q9H672	318 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PANK4	Q9NVE7	773 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	DERA	Q9Y315	318 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		27.8	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	OAZ2	O95190	189 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	SEC24A	O95486	1093 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	F13A1	P00488	732 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	LRG1	P02750	347 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	CASP5	P51878	434 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	ST13P5	Q8NFI4	369 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FGF13	Q92913	245 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FBXL21	Q9UKT6	434 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	PIEZO1	Q92508	2521 aa		27.79	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	CUTA	O60888	179 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	LILRA4	P59901	499 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	E2F4	Q16254	413 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	FGFBP2	Q9BYJ0	223 aa		27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
ASL-209	ENST00000493708	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		27.78	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms