RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 FAN1Q9Y2M0 1017 aa17.88■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 GOLGA6BA6NDN3 693 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 H3BRB1 525 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 PPFIA4O75335 1185 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 VTNP04004 478 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CD58P19256 250 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MAPK4P31152 587 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 GGCXP38435 758 aa17.87■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 CENPCQ03188 943 aa17.87■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 EFCAB13Q8IY85 973 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 TMEM192Q8IY95 271 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CCDC26Q8TAB7 109 aa17.87■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 TINF2Q9BSI4 451 aa17.87■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 TTI1O43156 1089 aa17.86■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.86■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 NOMO3P69849 1222 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ACVR2BQ13705 512 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 SEL1L2Q5TEA6 688 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MON1BQ7L1V2 547 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 LINC01465Q8N7H1 131 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 OR6J1Q8NGC5 347 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 C11orf70Q9BRQ4 267 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 TRIM7Q9C029 511 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ERVK-5Q9HDB9 667 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa17.86■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 ZNF699Q32M78 642 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 DUSP28Q4G0W2 176 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MTHFD1LQ6UB35 978 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 UBR7Q8N806 425 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa17.86■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MROH7Q68CQ1 1323 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 COL1A2P08123 1366 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZNF132P52740 706 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 PPFIA1Q13136 1202 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CUL1Q13616 776 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZNF394Q53GI3 561 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 NPLOC4Q8TAT6 608 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 NLRP7Q8WX94 980 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZNF606Q8WXB4 792 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CPB2Q96IY4 423 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 SCLT1Q96NL6 688 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CISHQ9NSE2 258 aa17.85■□□□□ 0.45
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TOM1-216ENST00000492723 RNF40O75150 1001 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MMP3P08254 477 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 WEE2P0C1S8 567 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CTNNA2P26232 953 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 AMHR2Q16671 573 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 FAM187BQ17R55 369 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 LIN9Q5TKA1 542 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 WHAMMQ8TF30 809 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ADAM21Q9UKJ8 722 aa17.85■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 IL18RAPO95256 599 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 KRT19P08727 400 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 STAG3L1P0CL83 205 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 GRIK4Q16099 956 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 PPP2R5EQ16537 467 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 CPA4Q9UI42 421 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 MYO1FO00160 1098 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 ZEB2O60315 1214 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 RWDD2BP57060 319 aa17.84■□□□□ 0.45
TOM1-216ENST00000492723 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP17.84■□□□□ 0.45
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