RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	DNAJB3	Q8WWF6	145 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	SYN2	Q92777	582 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PTPRH	Q9HD43	1115 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	MYO6	Q9UM54	1294 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.3	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TTC3	P53804	2025 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954		M0QZ92	97 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR32	O75388	356 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	NOL4	O94818	638 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TNNI1	P19237	187 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	RFX1	P22670	979 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PROZ	P22891	400 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	GCLM	P48507	274 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ACOT2	P49753	483 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	MXI1	P50539	228 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	DLG4	P78352	724 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	BTG3	Q14201	252 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	SFMBT2	Q5VUG0	894 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	RRAGA	Q7L523	313 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM139	Q8IV31	216 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PLVAP	Q9BX97	442 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	OSBPL7	Q9BZF2	842 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PLAGL2	Q9UPG8	496 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	USP20	Q9Y2K6	914 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	KIAA1671	Q9BY89	1806 aa		13.29	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1B0GUA9	196 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM221	A6NGB7	291 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954		M0R296	226 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TBX10	O75333	385 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	EDN1	P05305	212 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	DLAT	P10515	647 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	MCF2	P10911	925 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	UCHL3	P15374	230 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	AXL	P30530	894 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CRYBB1	P53674	252 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CLDN10	P78369	228 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP3CA	Q08209	521 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PDXDC1	Q6P996	788 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM65	Q6PJ69	517 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM81B	Q96LP2	452 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	PPP1R16B	Q96T49	567 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM117	Q9H0C3	514 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		13.28	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.27	□□□□□ -0.28
CIZ1-223	ENST00000491954	GOLGA6L9	A6NEM1	432 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	ABLIM1	O14639	778 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	EPHB6	O15197	1021 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	LINC01565	O15544	149 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	GHR	P10912	638 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	ARF4	P18085	180 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.27	□□□□□ -0.29	2e-7	■■□□□ 12.5
CIZ1-223	ENST00000491954	CYLC1	P35663	651 aa	Predicted RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	ADAM15	Q13444	863 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	MEA1	Q16626	185 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	KIZ	Q2M2Z5	673 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	FAM26D	Q5JW98	314 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	RUFY4	Q6ZNE9	571 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	CATSPER4	Q7RTX7	472 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	BAP1	Q92560	729 aa		13.27	□□□□□ -0.29
CIZ1-223	ENST00000491954	STK33	Q9BYT3	514 aa		13.27	□□□□□ -0.29

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