RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489909.1

MCCC1-208, Transcript of methylcrotonoyl-CoA carboxylase 1, human

TSL 3

Gene MCCC1, Length 458 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MCCC1-208	ENST00000489909	LEFTY2	O00292	366 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TBX3	O15119	743 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ZNF623	O75123	536 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	HAUS5	O94927	633 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	POMC	P01189	267 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MYF5	P13349	255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	COMT	P21964	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PHKA1	P46020	1223 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TM4SF4	P48230	202 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SCNN1G	P51170	649 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SOX8	P57073	446 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SLFN5	Q08AF3	891 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NFIX	Q14938	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PPP4R4	Q6NUP7	873 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MAML1	Q92585	1016 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	DPH1	Q9BZG8	443 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SLAMF7	Q9NQ25	335 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909		E9PLN8	166 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PLIN1	O60240	522 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MFAP3L	O75121	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ITGB1	P05556	798 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	GJB1	P08034	283 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MYL3	P08590	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PIK3CB	P42338	1070 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	CHN2	P52757	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NOMO3	P69849	1222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ATP2B3	Q16720	1220 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	CXorf38	Q8TB03	319 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PGBD4	Q96DM1	585 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	APIP	Q96GX9	242 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KLHL32	Q96NJ5	620 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MNT	Q99583	582 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	BDH2	Q9BUT1	245 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	RSAD1	Q9HA92	442 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	RLIM	Q9NVW2	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ST6GALNAC2	Q9UJ37	374 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MED16	Q9Y2X0	877 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PEX14	O75381	377 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	DNAJB5	O75953	348 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	AGFG2	O95081	481 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	RARB	P10826	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ALAS1	P13196	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	GCSH	P23434	173 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SERPINB3	P29508	390 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SLC7A1	P30825	629 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	CRB2	Q5IJ48	1285 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	MED25	Q71SY5	747 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SESTD1	Q86VW0	696 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	FITM2	Q8N6M3	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	EDA	Q92838	391 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	PMM1	Q92871	262 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	TLR10	Q9BXR5	811 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	BTBD1	Q9H0C5	482 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MCCC1-208	ENST00000489909	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68

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