RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		6.08	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSCB	Q8IWL3	235 aa		6.08	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC39A13	Q96H72	371 aa		6.08	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	6.08	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TNR	Q92752	1358 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CYR61	O00622	381 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SH3BP5	O60239	455 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ULK1	O75385	1050 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CASR	P41180	1078 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ID4	P47928	161 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SCNN1G	P51170	649 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	HMGA2	P52926	109 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	DUSP2	Q05923	314 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TUBA3C	Q13748	450 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	RASSF3	Q86WH2	238 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	UNC5B	Q8IZJ1	945 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	COG1	Q8WTW3	980 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRAM1	Q96QH2	718 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	OBP2A	Q9NY56	170 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	IP6K2	Q9UHH9	426 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	NUMBL	Q9Y6R0	609 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MED14	O60244	1454 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SHPRH	Q149N8	1683 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679		A0A1W2PP64	1363 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MET	P08581	1390 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	KIF16B	Q96L93	1317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679		K7ESF4	209 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MTSS1	O43312	755 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	STC2	O76061	302 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	LPL	P06858	475 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	HK1	P19367	917 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MCM7	P33993	719 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	GPR15	P49685	360 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM193A	P78312	1265 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CT83	Q5H943	113 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TICAM2	Q86XR7	235 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMPRSS6	Q8IU80	811 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR14C36	Q8NHC7	312 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ST8SIA2	Q92186	375 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SNX21	Q969T3	373 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MRI	Q9BWK5	157 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	STK26	Q9P289	416 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRSS50	Q9UI38	385 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	IQSEC2	Q5JU85	1478 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ADAMTS13	Q76LX8	1427 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TMEM2	Q9UHN6	1383 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	VSTM5	A8MXK1	200 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM20B	O75063	409 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRKD3	O94806	890 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRIM27	P14373	513 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	VCAM1	P19320	739 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ACVRL1	P37023	503 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	LGALS4	P56470	323 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SESN3	P58005	492 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLF10	Q13118	480 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	PICALM	Q13492	652 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	MORC3	Q14149	939 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FHL2	Q14192	279 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	UGT8	Q16880	541 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLEC17A	Q6ZS10	378 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ABCF1	Q8NE71	845 aa	Known RBP eCLIP	6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	WNT8A	Q9H1J5	351 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CHST12	Q9NRB3	414 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	EDAR	Q9UNE0	448 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	CPS1	P31327	1500 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		6.04	□□□□□ -1.44

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms